Protein–RNA interactions for Protein: P08923

Ltk, Leukocyte tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtkP08923 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LtkP08923 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LtkP08923 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LtkP08923 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LtkP08923 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LtkP08923 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LtkP08923 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LtkP08923 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LtkP08923 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LtkP08923 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LtkP08923 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LtkP08923 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LtkP08923 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LtkP08923 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LtkP08923 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LtkP08923 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LtkP08923 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LtkP08923 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LtkP08923 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LtkP08923 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LtkP08923 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LtkP08923 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LtkP08923 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LtkP08923 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LtkP08923 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LtkP08923 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LtkP08923 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LtkP08923 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LtkP08923 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LtkP08923 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LtkP08923 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LtkP08923 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LtkP08923 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LtkP08923 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LtkP08923 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LtkP08923 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LtkP08923 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LtkP08923 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LtkP08923 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LtkP08923 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LtkP08923 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LtkP08923 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LtkP08923 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LtkP08923 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LtkP08923 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LtkP08923 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LtkP08923 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LtkP08923 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LtkP08923 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LtkP08923 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LtkP08923 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LtkP08923 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LtkP08923 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LtkP08923 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LtkP08923 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LtkP08923 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LtkP08923 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LtkP08923 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LtkP08923 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
LtkP08923 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LtkP08923 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LtkP08923 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LtkP08923 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LtkP08923 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LtkP08923 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LtkP08923 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LtkP08923 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LtkP08923 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LtkP08923 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LtkP08923 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LtkP08923 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LtkP08923 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LtkP08923 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LtkP08923 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LtkP08923 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LtkP08923 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LtkP08923 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LtkP08923 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LtkP08923 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LtkP08923 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LtkP08923 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LtkP08923 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LtkP08923 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LtkP08923 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LtkP08923 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LtkP08923 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LtkP08923 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LtkP08923 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LtkP08923 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LtkP08923 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LtkP08923 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LtkP08923 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LtkP08923 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LtkP08923 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LtkP08923 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LtkP08923 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LtkP08923 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LtkP08923 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
LtkP08923 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LtkP08923 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms