Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NefmP08553 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NefmP08553 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NefmP08553 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NefmP08553 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NefmP08553 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NefmP08553 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NefmP08553 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NefmP08553 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NefmP08553 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NefmP08553 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
NefmP08553 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
NefmP08553 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
NefmP08553 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NefmP08553 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NefmP08553 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NefmP08553 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NefmP08553 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
NefmP08553 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
NefmP08553 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
NefmP08553 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NefmP08553 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NefmP08553 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NefmP08553 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NefmP08553 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NefmP08553 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
NefmP08553 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NefmP08553 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NefmP08553 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NefmP08553 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NefmP08553 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NefmP08553 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NefmP08553 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NefmP08553 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NefmP08553 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NefmP08553 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NefmP08553 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NefmP08553 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NefmP08553 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NefmP08553 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NefmP08553 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NefmP08553 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NefmP08553 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NefmP08553 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NefmP08553 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NefmP08553 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NefmP08553 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NefmP08553 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NefmP08553 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NefmP08553 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NefmP08553 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NefmP08553 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NefmP08553 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NefmP08553 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NefmP08553 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NefmP08553 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NefmP08553 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NefmP08553 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NefmP08553 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NefmP08553 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
NefmP08553 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
NefmP08553 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
NefmP08553 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NefmP08553 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NefmP08553 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NefmP08553 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NefmP08553 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NefmP08553 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NefmP08553 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NefmP08553 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NefmP08553 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NefmP08553 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
NefmP08553 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
NefmP08553 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NefmP08553 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
NefmP08553 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NefmP08553 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NefmP08553 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
NefmP08553 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NefmP08553 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NefmP08553 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NefmP08553 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NefmP08553 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NefmP08553 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NefmP08553 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NefmP08553 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NefmP08553 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
NefmP08553 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NefmP08553 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NefmP08553 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NefmP08553 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NefmP08553 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NefmP08553 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NefmP08553 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NefmP08553 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NefmP08553 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NefmP08553 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NefmP08553 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
NefmP08553 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NefmP08553 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms