Protein–RNA interactions for Protein: P05531

Xlr, X-linked lymphocyte-regulated protein PM1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XlrP05531 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XlrP05531 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XlrP05531 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XlrP05531 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XlrP05531 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XlrP05531 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XlrP05531 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XlrP05531 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XlrP05531 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XlrP05531 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XlrP05531 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XlrP05531 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XlrP05531 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XlrP05531 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XlrP05531 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XlrP05531 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XlrP05531 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XlrP05531 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XlrP05531 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XlrP05531 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XlrP05531 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XlrP05531 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XlrP05531 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XlrP05531 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XlrP05531 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XlrP05531 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XlrP05531 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
XlrP05531 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XlrP05531 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XlrP05531 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
XlrP05531 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XlrP05531 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XlrP05531 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XlrP05531 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XlrP05531 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XlrP05531 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XlrP05531 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XlrP05531 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XlrP05531 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XlrP05531 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XlrP05531 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XlrP05531 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XlrP05531 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XlrP05531 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XlrP05531 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
XlrP05531 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
XlrP05531 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
XlrP05531 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XlrP05531 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XlrP05531 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XlrP05531 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XlrP05531 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XlrP05531 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XlrP05531 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XlrP05531 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XlrP05531 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XlrP05531 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
XlrP05531 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XlrP05531 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XlrP05531 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XlrP05531 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XlrP05531 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XlrP05531 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XlrP05531 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XlrP05531 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
XlrP05531 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XlrP05531 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XlrP05531 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XlrP05531 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XlrP05531 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XlrP05531 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
XlrP05531 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XlrP05531 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XlrP05531 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XlrP05531 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XlrP05531 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
XlrP05531 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XlrP05531 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XlrP05531 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XlrP05531 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XlrP05531 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XlrP05531 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XlrP05531 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XlrP05531 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
XlrP05531 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XlrP05531 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XlrP05531 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XlrP05531 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
XlrP05531 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XlrP05531 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XlrP05531 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
XlrP05531 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
XlrP05531 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XlrP05531 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XlrP05531 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XlrP05531 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XlrP05531 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XlrP05531 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XlrP05531 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XlrP05531 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms