Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2-Eb1P04230 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2-Eb1P04230 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2-Eb1P04230 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2-Eb1P04230 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2-Eb1P04230 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2-Eb1P04230 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2-Eb1P04230 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2-Eb1P04230 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2-Eb1P04230 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2-Eb1P04230 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2-Eb1P04230 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2-Eb1P04230 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2-Eb1P04230 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2-Eb1P04230 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2-Eb1P04230 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2-Eb1P04230 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2-Eb1P04230 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2-Eb1P04230 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2-Eb1P04230 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2-Eb1P04230 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
H2-Eb1P04230 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2-Eb1P04230 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2-Eb1P04230 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2-Eb1P04230 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
H2-Eb1P04230 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2-Eb1P04230 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2-Eb1P04230 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2-Eb1P04230 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2-Eb1P04230 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2-Eb1P04230 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2-Eb1P04230 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2-Eb1P04230 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2-Eb1P04230 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2-Eb1P04230 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2-Eb1P04230 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2-Eb1P04230 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2-Eb1P04230 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2-Eb1P04230 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2-Eb1P04230 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
H2-Eb1P04230 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2-Eb1P04230 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2-Eb1P04230 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2-Eb1P04230 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2-Eb1P04230 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2-Eb1P04230 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2-Eb1P04230 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2-Eb1P04230 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2-Eb1P04230 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2-Eb1P04230 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2-Eb1P04230 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
H2-Eb1P04230 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2-Eb1P04230 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2-Eb1P04230 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2-Eb1P04230 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
H2-Eb1P04230 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2-Eb1P04230 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2-Eb1P04230 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2-Eb1P04230 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2-Eb1P04230 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2-Eb1P04230 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
H2-Eb1P04230 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2-Eb1P04230 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2-Eb1P04230 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2-Eb1P04230 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2-Eb1P04230 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2-Eb1P04230 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2-Eb1P04230 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2-Eb1P04230 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2-Eb1P04230 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2-Eb1P04230 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2-Eb1P04230 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2-Eb1P04230 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2-Eb1P04230 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
H2-Eb1P04230 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2-Eb1P04230 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2-Eb1P04230 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2-Eb1P04230 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2-Eb1P04230 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2-Eb1P04230 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
H2-Eb1P04230 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
H2-Eb1P04230 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2-Eb1P04230 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2-Eb1P04230 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2-Eb1P04230 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2-Eb1P04230 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2-Eb1P04230 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2-Eb1P04230 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2-Eb1P04230 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2-Eb1P04230 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2-Eb1P04230 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2-Eb1P04230 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2-Eb1P04230 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2-Eb1P04230 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2-Eb1P04230 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2-Eb1P04230 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2-Eb1P04230 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2-Eb1P04230 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
H2-Eb1P04230 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2-Eb1P04230 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms