Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tp53P02340 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tp53P02340 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tp53P02340 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tp53P02340 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tp53P02340 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tp53P02340 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tp53P02340 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tp53P02340 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tp53P02340 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tp53P02340 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tp53P02340 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tp53P02340 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tp53P02340 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tp53P02340 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tp53P02340 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tp53P02340 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tp53P02340 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tp53P02340 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tp53P02340 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tp53P02340 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Tp53P02340 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Tp53P02340 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tp53P02340 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tp53P02340 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tp53P02340 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tp53P02340 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tp53P02340 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Tp53P02340 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tp53P02340 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tp53P02340 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tp53P02340 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tp53P02340 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tp53P02340 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tp53P02340 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tp53P02340 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tp53P02340 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tp53P02340 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tp53P02340 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tp53P02340 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tp53P02340 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tp53P02340 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tp53P02340 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tp53P02340 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tp53P02340 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tp53P02340 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tp53P02340 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tp53P02340 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tp53P02340 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tp53P02340 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tp53P02340 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tp53P02340 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tp53P02340 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tp53P02340 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Tp53P02340 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tp53P02340 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tp53P02340 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tp53P02340 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tp53P02340 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tp53P02340 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tp53P02340 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tp53P02340 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tp53P02340 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tp53P02340 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tp53P02340 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tp53P02340 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tp53P02340 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tp53P02340 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tp53P02340 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tp53P02340 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tp53P02340 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tp53P02340 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tp53P02340 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tp53P02340 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tp53P02340 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tp53P02340 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tp53P02340 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tp53P02340 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tp53P02340 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tp53P02340 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tp53P02340 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tp53P02340 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tp53P02340 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tp53P02340 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tp53P02340 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tp53P02340 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tp53P02340 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tp53P02340 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tp53P02340 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tp53P02340 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tp53P02340 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tp53P02340 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tp53P02340 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tp53P02340 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tp53P02340 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tp53P02340 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tp53P02340 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tp53P02340 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tp53P02340 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tp53P02340 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms