Protein–RNA interactions for Protein: P01821

Ig heavy chain V region MC101, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01821 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01821 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01821 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01821 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01821 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01821 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01821 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01821 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01821 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01821 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01821 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01821 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01821 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01821 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01821 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01821 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01821 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01821 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01821 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01821 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01821 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01821 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01821 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01821 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01821 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01821 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01821 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01821 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01821 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01821 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01821 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01821 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01821 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01821 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01821 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01821 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01821 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01821 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01821 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01821 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01821 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01821 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01821 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01821 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01821 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01821 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01821 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01821 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01821 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01821 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01821 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01821 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01821 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01821 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01821 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01821 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01821 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01821 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01821 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01821 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01821 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01821 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01821 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01821 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01821 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01821 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01821 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01821 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01821 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01821 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01821 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01821 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01821 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01821 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01821 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01821 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01821 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01821 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01821 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01821 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01821 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01821 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01821 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01821 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01821 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01821 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01821 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01821 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01821 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01821 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01821 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01821 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01821 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01821 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01821 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01821 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01821 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01821 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01821 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01821 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms