Protein–RNA interactions for Protein: P01738

T-cell receptor alpha chain V region PHDS58, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01738 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01738 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01738 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01738 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01738 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01738 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01738 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01738 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01738 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01738 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01738 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01738 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01738 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01738 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01738 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01738 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01738 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01738 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01738 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01738 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01738 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01738 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01738 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01738 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01738 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01738 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01738 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01738 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01738 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01738 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01738 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01738 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01738 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01738 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
P01738 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01738 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01738 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01738 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01738 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01738 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01738 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01738 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01738 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01738 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01738 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01738 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01738 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01738 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01738 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01738 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01738 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01738 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01738 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01738 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01738 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01738 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01738 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01738 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01738 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01738 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01738 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01738 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01738 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01738 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01738 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01738 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01738 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01738 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01738 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01738 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01738 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01738 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01738 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01738 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01738 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01738 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01738 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01738 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01738 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01738 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01738 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01738 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01738 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01738 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01738 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01738 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01738 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01738 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01738 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01738 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01738 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01738 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01738 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01738 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01738 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01738 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01738 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01738 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01738 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01738 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms