Protein–RNA interactions for Protein: P01657

Ig kappa chain V-III region PC 2413, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01657 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
P01657 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01657 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01657 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01657 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01657 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
P01657 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01657 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01657 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01657 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01657 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01657 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01657 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01657 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01657 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01657 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P01657 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
P01657 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01657 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01657 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01657 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01657 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01657 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01657 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01657 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01657 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01657 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01657 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01657 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01657 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01657 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01657 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01657 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01657 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01657 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01657 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01657 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
P01657 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01657 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01657 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01657 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01657 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
P01657 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01657 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01657 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
P01657 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01657 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01657 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01657 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01657 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01657 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01657 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01657 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01657 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01657 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01657 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01657 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01657 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01657 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01657 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01657 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01657 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01657 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01657 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01657 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01657 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01657 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01657 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01657 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01657 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
P01657 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01657 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01657 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01657 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01657 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01657 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01657 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01657 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
P01657 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
P01657 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01657 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01657 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01657 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
P01657 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
P01657 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01657 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
P01657 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01657 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01657 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
P01657 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01657 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01657 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01657 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
P01657 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01657 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01657 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01657 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
P01657 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01657 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
P01657 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms