Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01638 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01638 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01638 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01638 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01638 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01638 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01638 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01638 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01638 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01638 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01638 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01638 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01638 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01638 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01638 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01638 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01638 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01638 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01638 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01638 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01638 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01638 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01638 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01638 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01638 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01638 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01638 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01638 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
P01638 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22■■□□□ 1.11
P01638 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01638 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01638 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01638 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01638 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01638 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01638 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01638 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01638 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01638 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01638 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01638 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01638 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01638 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
P01638 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01638 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
P01638 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01638 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01638 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01638 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01638 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01638 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01638 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01638 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01638 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01638 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01638 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01638 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01638 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01638 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01638 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01638 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01638 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01638 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01638 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01638 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
P01638 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01638 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01638 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01638 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01638 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01638 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01638 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01638 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01638 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01638 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01638 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01638 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01638 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01638 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01638 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01638 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01638 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01638 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01638 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01638 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01638 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01638 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01638 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01638 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01638 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01638 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01638 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01638 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
P01638 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01638 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
P01638 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01638 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01638 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01638 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms