Protein–RNA interactions for Protein: O89116

Vti1a, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1aO89116 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vti1aO89116 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vti1aO89116 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vti1aO89116 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vti1aO89116 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vti1aO89116 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vti1aO89116 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vti1aO89116 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vti1aO89116 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vti1aO89116 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vti1aO89116 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vti1aO89116 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vti1aO89116 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vti1aO89116 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vti1aO89116 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vti1aO89116 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vti1aO89116 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vti1aO89116 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vti1aO89116 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vti1aO89116 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vti1aO89116 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vti1aO89116 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vti1aO89116 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vti1aO89116 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Vti1aO89116 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vti1aO89116 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vti1aO89116 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vti1aO89116 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vti1aO89116 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vti1aO89116 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Vti1aO89116 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vti1aO89116 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vti1aO89116 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vti1aO89116 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vti1aO89116 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vti1aO89116 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vti1aO89116 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Vti1aO89116 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vti1aO89116 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vti1aO89116 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vti1aO89116 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vti1aO89116 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vti1aO89116 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vti1aO89116 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vti1aO89116 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vti1aO89116 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vti1aO89116 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vti1aO89116 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vti1aO89116 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vti1aO89116 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vti1aO89116 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vti1aO89116 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vti1aO89116 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vti1aO89116 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vti1aO89116 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vti1aO89116 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vti1aO89116 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vti1aO89116 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Vti1aO89116 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vti1aO89116 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Vti1aO89116 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vti1aO89116 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Vti1aO89116 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vti1aO89116 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vti1aO89116 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vti1aO89116 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vti1aO89116 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vti1aO89116 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vti1aO89116 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vti1aO89116 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vti1aO89116 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vti1aO89116 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vti1aO89116 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vti1aO89116 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vti1aO89116 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vti1aO89116 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vti1aO89116 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vti1aO89116 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vti1aO89116 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vti1aO89116 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vti1aO89116 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vti1aO89116 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vti1aO89116 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Vti1aO89116 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vti1aO89116 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Vti1aO89116 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vti1aO89116 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vti1aO89116 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vti1aO89116 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Vti1aO89116 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vti1aO89116 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vti1aO89116 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Vti1aO89116 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Vti1aO89116 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vti1aO89116 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Vti1aO89116 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vti1aO89116 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vti1aO89116 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vti1aO89116 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vti1aO89116 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms