Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sp1O89090 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sp1O89090 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sp1O89090 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sp1O89090 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sp1O89090 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sp1O89090 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sp1O89090 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sp1O89090 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sp1O89090 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sp1O89090 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sp1O89090 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sp1O89090 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sp1O89090 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sp1O89090 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sp1O89090 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sp1O89090 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sp1O89090 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sp1O89090 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sp1O89090 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sp1O89090 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sp1O89090 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sp1O89090 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sp1O89090 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sp1O89090 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Sp1O89090 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sp1O89090 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sp1O89090 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Sp1O89090 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sp1O89090 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sp1O89090 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sp1O89090 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sp1O89090 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sp1O89090 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sp1O89090 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sp1O89090 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sp1O89090 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sp1O89090 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sp1O89090 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sp1O89090 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sp1O89090 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sp1O89090 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sp1O89090 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sp1O89090 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sp1O89090 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sp1O89090 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sp1O89090 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sp1O89090 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sp1O89090 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sp1O89090 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sp1O89090 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sp1O89090 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sp1O89090 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sp1O89090 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sp1O89090 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sp1O89090 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sp1O89090 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sp1O89090 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sp1O89090 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sp1O89090 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sp1O89090 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sp1O89090 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sp1O89090 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sp1O89090 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sp1O89090 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sp1O89090 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sp1O89090 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sp1O89090 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sp1O89090 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sp1O89090 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sp1O89090 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sp1O89090 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sp1O89090 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sp1O89090 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sp1O89090 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sp1O89090 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sp1O89090 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sp1O89090 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sp1O89090 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sp1O89090 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sp1O89090 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sp1O89090 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sp1O89090 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sp1O89090 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Sp1O89090 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sp1O89090 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sp1O89090 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sp1O89090 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sp1O89090 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sp1O89090 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sp1O89090 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sp1O89090 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sp1O89090 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sp1O89090 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sp1O89090 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sp1O89090 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sp1O89090 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sp1O89090 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sp1O89090 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sp1O89090 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1171 ms