Protein–RNA interactions for Protein: O89001

Cpd, Carboxypeptidase D, mousemouse

Predictions only

Length 1,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpdO89001 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CpdO89001 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CpdO89001 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CpdO89001 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CpdO89001 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CpdO89001 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CpdO89001 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CpdO89001 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CpdO89001 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CpdO89001 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CpdO89001 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CpdO89001 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CpdO89001 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CpdO89001 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CpdO89001 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CpdO89001 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CpdO89001 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CpdO89001 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CpdO89001 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CpdO89001 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CpdO89001 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CpdO89001 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CpdO89001 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CpdO89001 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CpdO89001 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CpdO89001 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CpdO89001 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CpdO89001 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CpdO89001 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CpdO89001 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CpdO89001 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CpdO89001 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CpdO89001 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CpdO89001 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CpdO89001 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CpdO89001 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CpdO89001 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CpdO89001 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CpdO89001 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CpdO89001 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CpdO89001 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CpdO89001 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
CpdO89001 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CpdO89001 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CpdO89001 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CpdO89001 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CpdO89001 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CpdO89001 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CpdO89001 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CpdO89001 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CpdO89001 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CpdO89001 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CpdO89001 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CpdO89001 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CpdO89001 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CpdO89001 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CpdO89001 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CpdO89001 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CpdO89001 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CpdO89001 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CpdO89001 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CpdO89001 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CpdO89001 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CpdO89001 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CpdO89001 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CpdO89001 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CpdO89001 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CpdO89001 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CpdO89001 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CpdO89001 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CpdO89001 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CpdO89001 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CpdO89001 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CpdO89001 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CpdO89001 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CpdO89001 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CpdO89001 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CpdO89001 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CpdO89001 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CpdO89001 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CpdO89001 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CpdO89001 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CpdO89001 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CpdO89001 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CpdO89001 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CpdO89001 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CpdO89001 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CpdO89001 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CpdO89001 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CpdO89001 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CpdO89001 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CpdO89001 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CpdO89001 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CpdO89001 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CpdO89001 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CpdO89001 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CpdO89001 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CpdO89001 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CpdO89001 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CpdO89001 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms