Protein–RNA interactions for Protein: O88602

Cacng2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng2O88602 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacng2O88602 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacng2O88602 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacng2O88602 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacng2O88602 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacng2O88602 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacng2O88602 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacng2O88602 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacng2O88602 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacng2O88602 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacng2O88602 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacng2O88602 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacng2O88602 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacng2O88602 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacng2O88602 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacng2O88602 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacng2O88602 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacng2O88602 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacng2O88602 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacng2O88602 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacng2O88602 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacng2O88602 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacng2O88602 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacng2O88602 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacng2O88602 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacng2O88602 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cacng2O88602 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cacng2O88602 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Cacng2O88602 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacng2O88602 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacng2O88602 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacng2O88602 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacng2O88602 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacng2O88602 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacng2O88602 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacng2O88602 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cacng2O88602 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cacng2O88602 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacng2O88602 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacng2O88602 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacng2O88602 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacng2O88602 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacng2O88602 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacng2O88602 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacng2O88602 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cacng2O88602 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cacng2O88602 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cacng2O88602 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cacng2O88602 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacng2O88602 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacng2O88602 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacng2O88602 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacng2O88602 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cacng2O88602 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cacng2O88602 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cacng2O88602 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cacng2O88602 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cacng2O88602 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cacng2O88602 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cacng2O88602 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cacng2O88602 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cacng2O88602 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cacng2O88602 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cacng2O88602 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cacng2O88602 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cacng2O88602 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacng2O88602 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacng2O88602 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacng2O88602 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacng2O88602 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacng2O88602 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacng2O88602 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacng2O88602 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacng2O88602 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacng2O88602 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacng2O88602 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacng2O88602 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacng2O88602 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacng2O88602 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacng2O88602 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacng2O88602 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacng2O88602 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacng2O88602 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacng2O88602 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacng2O88602 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacng2O88602 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacng2O88602 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacng2O88602 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacng2O88602 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacng2O88602 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacng2O88602 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacng2O88602 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacng2O88602 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacng2O88602 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacng2O88602 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cacng2O88602 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cacng2O88602 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cacng2O88602 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cacng2O88602 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cacng2O88602 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms