Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cops3O88543 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops3O88543 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops3O88543 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cops3O88543 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cops3O88543 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cops3O88543 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cops3O88543 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cops3O88543 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cops3O88543 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cops3O88543 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cops3O88543 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cops3O88543 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cops3O88543 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cops3O88543 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cops3O88543 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cops3O88543 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cops3O88543 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cops3O88543 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cops3O88543 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cops3O88543 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cops3O88543 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cops3O88543 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cops3O88543 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cops3O88543 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cops3O88543 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cops3O88543 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cops3O88543 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cops3O88543 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cops3O88543 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cops3O88543 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cops3O88543 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cops3O88543 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cops3O88543 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cops3O88543 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cops3O88543 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cops3O88543 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cops3O88543 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cops3O88543 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cops3O88543 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cops3O88543 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cops3O88543 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cops3O88543 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cops3O88543 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cops3O88543 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cops3O88543 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cops3O88543 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cops3O88543 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cops3O88543 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cops3O88543 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cops3O88543 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cops3O88543 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cops3O88543 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cops3O88543 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cops3O88543 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cops3O88543 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cops3O88543 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cops3O88543 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cops3O88543 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cops3O88543 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cops3O88543 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cops3O88543 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cops3O88543 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cops3O88543 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cops3O88543 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cops3O88543 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cops3O88543 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cops3O88543 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cops3O88543 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cops3O88543 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cops3O88543 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cops3O88543 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cops3O88543 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cops3O88543 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cops3O88543 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cops3O88543 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cops3O88543 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cops3O88543 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cops3O88543 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cops3O88543 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cops3O88543 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cops3O88543 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cops3O88543 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cops3O88543 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cops3O88543 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cops3O88543 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cops3O88543 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cops3O88543 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cops3O88543 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cops3O88543 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cops3O88543 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cops3O88543 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cops3O88543 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cops3O88543 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cops3O88543 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cops3O88543 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cops3O88543 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cops3O88543 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cops3O88543 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cops3O88543 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms