Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ChkbO55229 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ChkbO55229 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ChkbO55229 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ChkbO55229 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ChkbO55229 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ChkbO55229 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ChkbO55229 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ChkbO55229 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ChkbO55229 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ChkbO55229 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ChkbO55229 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ChkbO55229 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ChkbO55229 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ChkbO55229 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ChkbO55229 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ChkbO55229 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ChkbO55229 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ChkbO55229 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ChkbO55229 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ChkbO55229 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ChkbO55229 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ChkbO55229 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ChkbO55229 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ChkbO55229 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ChkbO55229 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ChkbO55229 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ChkbO55229 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ChkbO55229 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ChkbO55229 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ChkbO55229 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ChkbO55229 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ChkbO55229 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ChkbO55229 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChkbO55229 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChkbO55229 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChkbO55229 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ChkbO55229 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ChkbO55229 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ChkbO55229 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ChkbO55229 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ChkbO55229 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ChkbO55229 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ChkbO55229 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ChkbO55229 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ChkbO55229 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ChkbO55229 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ChkbO55229 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ChkbO55229 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ChkbO55229 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ChkbO55229 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ChkbO55229 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ChkbO55229 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ChkbO55229 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ChkbO55229 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ChkbO55229 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ChkbO55229 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ChkbO55229 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ChkbO55229 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ChkbO55229 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ChkbO55229 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ChkbO55229 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ChkbO55229 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ChkbO55229 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ChkbO55229 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ChkbO55229 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ChkbO55229 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ChkbO55229 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ChkbO55229 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ChkbO55229 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ChkbO55229 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ChkbO55229 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ChkbO55229 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ChkbO55229 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ChkbO55229 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ChkbO55229 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ChkbO55229 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ChkbO55229 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ChkbO55229 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ChkbO55229 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ChkbO55229 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ChkbO55229 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ChkbO55229 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ChkbO55229 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ChkbO55229 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ChkbO55229 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ChkbO55229 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ChkbO55229 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ChkbO55229 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ChkbO55229 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ChkbO55229 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ChkbO55229 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ChkbO55229 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ChkbO55229 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ChkbO55229 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ChkbO55229 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ChkbO55229 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ChkbO55229 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ChkbO55229 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ChkbO55229 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms