Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cyp26a1O55127 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cyp26a1O55127 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cyp26a1O55127 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cyp26a1O55127 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cyp26a1O55127 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cyp26a1O55127 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cyp26a1O55127 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cyp26a1O55127 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cyp26a1O55127 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cyp26a1O55127 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cyp26a1O55127 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cyp26a1O55127 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cyp26a1O55127 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cyp26a1O55127 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cyp26a1O55127 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cyp26a1O55127 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cyp26a1O55127 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cyp26a1O55127 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cyp26a1O55127 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cyp26a1O55127 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Cyp26a1O55127 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Cyp26a1O55127 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cyp26a1O55127 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cyp26a1O55127 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cyp26a1O55127 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cyp26a1O55127 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cyp26a1O55127 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cyp26a1O55127 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cyp26a1O55127 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cyp26a1O55127 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cyp26a1O55127 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cyp26a1O55127 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cyp26a1O55127 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cyp26a1O55127 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Cyp26a1O55127 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cyp26a1O55127 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cyp26a1O55127 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cyp26a1O55127 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cyp26a1O55127 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Cyp26a1O55127 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cyp26a1O55127 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cyp26a1O55127 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cyp26a1O55127 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cyp26a1O55127 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cyp26a1O55127 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cyp26a1O55127 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cyp26a1O55127 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cyp26a1O55127 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cyp26a1O55127 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cyp26a1O55127 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cyp26a1O55127 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cyp26a1O55127 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cyp26a1O55127 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cyp26a1O55127 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cyp26a1O55127 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cyp26a1O55127 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cyp26a1O55127 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cyp26a1O55127 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cyp26a1O55127 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cyp26a1O55127 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cyp26a1O55127 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cyp26a1O55127 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cyp26a1O55127 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cyp26a1O55127 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cyp26a1O55127 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cyp26a1O55127 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cyp26a1O55127 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cyp26a1O55127 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Cyp26a1O55127 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cyp26a1O55127 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cyp26a1O55127 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cyp26a1O55127 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cyp26a1O55127 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cyp26a1O55127 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cyp26a1O55127 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cyp26a1O55127 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cyp26a1O55127 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cyp26a1O55127 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cyp26a1O55127 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cyp26a1O55127 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cyp26a1O55127 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cyp26a1O55127 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Cyp26a1O55127 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cyp26a1O55127 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cyp26a1O55127 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Cyp26a1O55127 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cyp26a1O55127 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cyp26a1O55127 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cyp26a1O55127 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cyp26a1O55127 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cyp26a1O55127 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cyp26a1O55127 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Cyp26a1O55127 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cyp26a1O55127 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cyp26a1O55127 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Cyp26a1O55127 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Cyp26a1O55127 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cyp26a1O55127 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cyp26a1O55127 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms