Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trappc3O55013 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trappc3O55013 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trappc3O55013 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trappc3O55013 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Trappc3O55013 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trappc3O55013 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trappc3O55013 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trappc3O55013 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trappc3O55013 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trappc3O55013 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trappc3O55013 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trappc3O55013 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trappc3O55013 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trappc3O55013 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trappc3O55013 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trappc3O55013 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trappc3O55013 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trappc3O55013 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trappc3O55013 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trappc3O55013 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trappc3O55013 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trappc3O55013 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trappc3O55013 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc3O55013 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc3O55013 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc3O55013 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc3O55013 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc3O55013 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc3O55013 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc3O55013 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc3O55013 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc3O55013 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc3O55013 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trappc3O55013 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trappc3O55013 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trappc3O55013 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trappc3O55013 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trappc3O55013 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trappc3O55013 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trappc3O55013 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trappc3O55013 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trappc3O55013 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trappc3O55013 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trappc3O55013 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trappc3O55013 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trappc3O55013 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trappc3O55013 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trappc3O55013 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trappc3O55013 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trappc3O55013 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Trappc3O55013 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trappc3O55013 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trappc3O55013 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trappc3O55013 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trappc3O55013 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trappc3O55013 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trappc3O55013 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trappc3O55013 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trappc3O55013 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trappc3O55013 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trappc3O55013 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trappc3O55013 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trappc3O55013 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Trappc3O55013 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trappc3O55013 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trappc3O55013 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trappc3O55013 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trappc3O55013 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trappc3O55013 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trappc3O55013 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Trappc3O55013 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trappc3O55013 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trappc3O55013 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trappc3O55013 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trappc3O55013 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trappc3O55013 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trappc3O55013 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trappc3O55013 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trappc3O55013 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trappc3O55013 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trappc3O55013 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc3O55013 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc3O55013 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trappc3O55013 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trappc3O55013 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trappc3O55013 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trappc3O55013 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trappc3O55013 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trappc3O55013 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trappc3O55013 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trappc3O55013 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Trappc3O55013 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Trappc3O55013 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trappc3O55013 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trappc3O55013 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trappc3O55013 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Trappc3O55013 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trappc3O55013 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trappc3O55013 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms