Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Bnip3O55003 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Bnip3O55003 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Bnip3O55003 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Bnip3O55003 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Bnip3O55003 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Bnip3O55003 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Bnip3O55003 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Bnip3O55003 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Bnip3O55003 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Bnip3O55003 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Bnip3O55003 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Bnip3O55003 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Bnip3O55003 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Bnip3O55003 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Bnip3O55003 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Bnip3O55003 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Bnip3O55003 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Bnip3O55003 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Bnip3O55003 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Bnip3O55003 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Bnip3O55003 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Bnip3O55003 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Bnip3O55003 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Bnip3O55003 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Bnip3O55003 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Bnip3O55003 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Bnip3O55003 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Bnip3O55003 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Bnip3O55003 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Bnip3O55003 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Bnip3O55003 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Bnip3O55003 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Bnip3O55003 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Bnip3O55003 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Bnip3O55003 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Bnip3O55003 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Bnip3O55003 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Bnip3O55003 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Bnip3O55003 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Bnip3O55003 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Bnip3O55003 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Bnip3O55003 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Bnip3O55003 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Bnip3O55003 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Bnip3O55003 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Bnip3O55003 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Bnip3O55003 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Bnip3O55003 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Bnip3O55003 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Bnip3O55003 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Bnip3O55003 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Bnip3O55003 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Bnip3O55003 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Bnip3O55003 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Bnip3O55003 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Bnip3O55003 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Bnip3O55003 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Bnip3O55003 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Bnip3O55003 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Bnip3O55003 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Bnip3O55003 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Bnip3O55003 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Bnip3O55003 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Bnip3O55003 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Bnip3O55003 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Bnip3O55003 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Bnip3O55003 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Bnip3O55003 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Bnip3O55003 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Bnip3O55003 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Bnip3O55003 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Bnip3O55003 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Bnip3O55003 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Bnip3O55003 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Bnip3O55003 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Bnip3O55003 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Bnip3O55003 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Bnip3O55003 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Bnip3O55003 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Bnip3O55003 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Bnip3O55003 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Bnip3O55003 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Bnip3O55003 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Bnip3O55003 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Bnip3O55003 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Bnip3O55003 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Bnip3O55003 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Bnip3O55003 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Bnip3O55003 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Bnip3O55003 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Bnip3O55003 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Bnip3O55003 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Bnip3O55003 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Bnip3O55003 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Bnip3O55003 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Bnip3O55003 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Bnip3O55003 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Bnip3O55003 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Bnip3O55003 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms