Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2f6O54917 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2f6O54917 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2f6O54917 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2f6O54917 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2f6O54917 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2f6O54917 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2f6O54917 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2f6O54917 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
E2f6O54917 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2f6O54917 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2f6O54917 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2f6O54917 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2f6O54917 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2f6O54917 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2f6O54917 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2f6O54917 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2f6O54917 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2f6O54917 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2f6O54917 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2f6O54917 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2f6O54917 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2f6O54917 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
E2f6O54917 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2f6O54917 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2f6O54917 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2f6O54917 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2f6O54917 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2f6O54917 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2f6O54917 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2f6O54917 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2f6O54917 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2f6O54917 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2f6O54917 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2f6O54917 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2f6O54917 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2f6O54917 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2f6O54917 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2f6O54917 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2f6O54917 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2f6O54917 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2f6O54917 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2f6O54917 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2f6O54917 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
E2f6O54917 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2f6O54917 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2f6O54917 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2f6O54917 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2f6O54917 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2f6O54917 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2f6O54917 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
E2f6O54917 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2f6O54917 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2f6O54917 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2f6O54917 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2f6O54917 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2f6O54917 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2f6O54917 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2f6O54917 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
E2f6O54917 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2f6O54917 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2f6O54917 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2f6O54917 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2f6O54917 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2f6O54917 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2f6O54917 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2f6O54917 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2f6O54917 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
E2f6O54917 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2f6O54917 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2f6O54917 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2f6O54917 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2f6O54917 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2f6O54917 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2f6O54917 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2f6O54917 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2f6O54917 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
E2f6O54917 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2f6O54917 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2f6O54917 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2f6O54917 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2f6O54917 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2f6O54917 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2f6O54917 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
E2f6O54917 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2f6O54917 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2f6O54917 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2f6O54917 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
E2f6O54917 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2f6O54917 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2f6O54917 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2f6O54917 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2f6O54917 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2f6O54917 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2f6O54917 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2f6O54917 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2f6O54917 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2f6O54917 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2f6O54917 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2f6O54917 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms