Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tpd52l1O54818 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tpd52l1O54818 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tpd52l1O54818 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tpd52l1O54818 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tpd52l1O54818 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tpd52l1O54818 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tpd52l1O54818 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tpd52l1O54818 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tpd52l1O54818 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tpd52l1O54818 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tpd52l1O54818 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tpd52l1O54818 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Tpd52l1O54818 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tpd52l1O54818 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tpd52l1O54818 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tpd52l1O54818 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tpd52l1O54818 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tpd52l1O54818 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tpd52l1O54818 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tpd52l1O54818 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Tpd52l1O54818 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tpd52l1O54818 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tpd52l1O54818 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tpd52l1O54818 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Tpd52l1O54818 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Tpd52l1O54818 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tpd52l1O54818 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tpd52l1O54818 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Tpd52l1O54818 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tpd52l1O54818 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tpd52l1O54818 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tpd52l1O54818 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tpd52l1O54818 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tpd52l1O54818 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tpd52l1O54818 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tpd52l1O54818 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tpd52l1O54818 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tpd52l1O54818 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tpd52l1O54818 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tpd52l1O54818 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tpd52l1O54818 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tpd52l1O54818 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tpd52l1O54818 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tpd52l1O54818 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Tpd52l1O54818 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tpd52l1O54818 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tpd52l1O54818 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tpd52l1O54818 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tpd52l1O54818 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tpd52l1O54818 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tpd52l1O54818 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tpd52l1O54818 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tpd52l1O54818 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tpd52l1O54818 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tpd52l1O54818 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tpd52l1O54818 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tpd52l1O54818 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tpd52l1O54818 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tpd52l1O54818 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Tpd52l1O54818 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tpd52l1O54818 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tpd52l1O54818 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tpd52l1O54818 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tpd52l1O54818 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tpd52l1O54818 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tpd52l1O54818 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tpd52l1O54818 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tpd52l1O54818 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tpd52l1O54818 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tpd52l1O54818 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tpd52l1O54818 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Tpd52l1O54818 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Tpd52l1O54818 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tpd52l1O54818 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tpd52l1O54818 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tpd52l1O54818 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tpd52l1O54818 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tpd52l1O54818 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Tpd52l1O54818 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tpd52l1O54818 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tpd52l1O54818 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tpd52l1O54818 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tpd52l1O54818 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tpd52l1O54818 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tpd52l1O54818 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tpd52l1O54818 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tpd52l1O54818 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tpd52l1O54818 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tpd52l1O54818 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tpd52l1O54818 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tpd52l1O54818 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tpd52l1O54818 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tpd52l1O54818 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tpd52l1O54818 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tpd52l1O54818 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tpd52l1O54818 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tpd52l1O54818 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tpd52l1O54818 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tpd52l1O54818 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms