Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnfrsf18O35714 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnfrsf18O35714 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnfrsf18O35714 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnfrsf18O35714 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnfrsf18O35714 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnfrsf18O35714 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnfrsf18O35714 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnfrsf18O35714 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnfrsf18O35714 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnfrsf18O35714 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnfrsf18O35714 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnfrsf18O35714 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnfrsf18O35714 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnfrsf18O35714 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnfrsf18O35714 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnfrsf18O35714 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnfrsf18O35714 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnfrsf18O35714 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnfrsf18O35714 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnfrsf18O35714 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnfrsf18O35714 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnfrsf18O35714 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnfrsf18O35714 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnfrsf18O35714 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnfrsf18O35714 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnfrsf18O35714 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnfrsf18O35714 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnfrsf18O35714 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnfrsf18O35714 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnfrsf18O35714 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnfrsf18O35714 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnfrsf18O35714 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnfrsf18O35714 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnfrsf18O35714 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnfrsf18O35714 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnfrsf18O35714 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnfrsf18O35714 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnfrsf18O35714 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnfrsf18O35714 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnfrsf18O35714 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnfrsf18O35714 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnfrsf18O35714 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnfrsf18O35714 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnfrsf18O35714 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnfrsf18O35714 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnfrsf18O35714 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnfrsf18O35714 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnfrsf18O35714 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnfrsf18O35714 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnfrsf18O35714 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnfrsf18O35714 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnfrsf18O35714 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnfrsf18O35714 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnfrsf18O35714 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnfrsf18O35714 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnfrsf18O35714 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnfrsf18O35714 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnfrsf18O35714 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnfrsf18O35714 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnfrsf18O35714 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnfrsf18O35714 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnfrsf18O35714 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnfrsf18O35714 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnfrsf18O35714 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tnfrsf18O35714 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnfrsf18O35714 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnfrsf18O35714 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnfrsf18O35714 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnfrsf18O35714 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnfrsf18O35714 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnfrsf18O35714 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnfrsf18O35714 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnfrsf18O35714 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnfrsf18O35714 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnfrsf18O35714 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnfrsf18O35714 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnfrsf18O35714 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnfrsf18O35714 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnfrsf18O35714 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnfrsf18O35714 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnfrsf18O35714 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnfrsf18O35714 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnfrsf18O35714 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnfrsf18O35714 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnfrsf18O35714 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnfrsf18O35714 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnfrsf18O35714 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnfrsf18O35714 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnfrsf18O35714 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnfrsf18O35714 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnfrsf18O35714 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnfrsf18O35714 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnfrsf18O35714 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnfrsf18O35714 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnfrsf18O35714 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnfrsf18O35714 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnfrsf18O35714 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnfrsf18O35714 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnfrsf18O35714 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms