Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kpna3O35344 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kpna3O35344 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kpna3O35344 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kpna3O35344 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kpna3O35344 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kpna3O35344 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kpna3O35344 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kpna3O35344 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kpna3O35344 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kpna3O35344 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kpna3O35344 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kpna3O35344 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kpna3O35344 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kpna3O35344 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kpna3O35344 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kpna3O35344 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kpna3O35344 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kpna3O35344 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kpna3O35344 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kpna3O35344 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Kpna3O35344 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kpna3O35344 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Kpna3O35344 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kpna3O35344 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kpna3O35344 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kpna3O35344 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kpna3O35344 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kpna3O35344 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kpna3O35344 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kpna3O35344 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kpna3O35344 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kpna3O35344 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Kpna3O35344 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kpna3O35344 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kpna3O35344 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kpna3O35344 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kpna3O35344 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kpna3O35344 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kpna3O35344 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kpna3O35344 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kpna3O35344 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kpna3O35344 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kpna3O35344 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kpna3O35344 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kpna3O35344 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kpna3O35344 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kpna3O35344 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kpna3O35344 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kpna3O35344 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kpna3O35344 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kpna3O35344 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kpna3O35344 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kpna3O35344 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kpna3O35344 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kpna3O35344 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kpna3O35344 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kpna3O35344 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kpna3O35344 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kpna3O35344 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kpna3O35344 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kpna3O35344 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Kpna3O35344 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kpna3O35344 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kpna3O35344 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kpna3O35344 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kpna3O35344 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kpna3O35344 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kpna3O35344 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kpna3O35344 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kpna3O35344 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kpna3O35344 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kpna3O35344 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kpna3O35344 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kpna3O35344 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kpna3O35344 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kpna3O35344 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kpna3O35344 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kpna3O35344 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kpna3O35344 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kpna3O35344 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kpna3O35344 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kpna3O35344 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kpna3O35344 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kpna3O35344 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kpna3O35344 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kpna3O35344 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kpna3O35344 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kpna3O35344 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kpna3O35344 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kpna3O35344 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kpna3O35344 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kpna3O35344 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kpna3O35344 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kpna3O35344 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kpna3O35344 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kpna3O35344 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kpna3O35344 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kpna3O35344 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kpna3O35344 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.7 ms