Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc18a3O35304 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc18a3O35304 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc18a3O35304 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc18a3O35304 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc18a3O35304 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc18a3O35304 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc18a3O35304 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc18a3O35304 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc18a3O35304 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc18a3O35304 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc18a3O35304 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc18a3O35304 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc18a3O35304 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc18a3O35304 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc18a3O35304 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc18a3O35304 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc18a3O35304 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc18a3O35304 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc18a3O35304 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc18a3O35304 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc18a3O35304 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc18a3O35304 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc18a3O35304 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc18a3O35304 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc18a3O35304 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc18a3O35304 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc18a3O35304 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc18a3O35304 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc18a3O35304 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc18a3O35304 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc18a3O35304 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Slc18a3O35304 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc18a3O35304 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc18a3O35304 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc18a3O35304 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc18a3O35304 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc18a3O35304 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc18a3O35304 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc18a3O35304 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc18a3O35304 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc18a3O35304 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc18a3O35304 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc18a3O35304 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc18a3O35304 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc18a3O35304 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc18a3O35304 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc18a3O35304 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc18a3O35304 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc18a3O35304 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc18a3O35304 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc18a3O35304 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc18a3O35304 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc18a3O35304 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc18a3O35304 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc18a3O35304 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc18a3O35304 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc18a3O35304 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc18a3O35304 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc18a3O35304 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc18a3O35304 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc18a3O35304 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc18a3O35304 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc18a3O35304 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc18a3O35304 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc18a3O35304 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc18a3O35304 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc18a3O35304 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc18a3O35304 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc18a3O35304 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc18a3O35304 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc18a3O35304 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc18a3O35304 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc18a3O35304 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc18a3O35304 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc18a3O35304 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc18a3O35304 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc18a3O35304 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc18a3O35304 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc18a3O35304 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc18a3O35304 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc18a3O35304 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc18a3O35304 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc18a3O35304 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc18a3O35304 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc18a3O35304 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc18a3O35304 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc18a3O35304 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc18a3O35304 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc18a3O35304 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc18a3O35304 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc18a3O35304 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc18a3O35304 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc18a3O35304 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc18a3O35304 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc18a3O35304 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc18a3O35304 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc18a3O35304 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc18a3O35304 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc18a3O35304 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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