Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC34,97■■■■□ 3,19
Pkd2O35245 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,97■■■■□ 3,19
Pkd2O35245 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34,97■■■■□ 3,19
Pkd2O35245 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Pkd2O35245 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Pkd2O35245 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Pkd2O35245 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,18
Pkd2O35245 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
Pkd2O35245 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC34,93■■■■□ 3,18
Pkd2O35245 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC34,93■■■■□ 3,18
Pkd2O35245 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
Pkd2O35245 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC34,91■■■■□ 3,18
Pkd2O35245 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC34,89■■■■□ 3,18
Pkd2O35245 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Pkd2O35245 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Pkd2O35245 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Pkd2O35245 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34,86■■■■□ 3,17
Pkd2O35245 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC34,86■■■■□ 3,17
Pkd2O35245 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
Pkd2O35245 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
Pkd2O35245 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Pkd2O35245 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC34,83■■■■□ 3,17
Pkd2O35245 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34,82■■■■□ 3,17
Pkd2O35245 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,82■■■■□ 3,17
Pkd2O35245 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,82■■■■□ 3,17
Pkd2O35245 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Pkd2O35245 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Pkd2O35245 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,78■■■■□ 3,16
Pkd2O35245 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34,78■■■■□ 3,16
Pkd2O35245 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC34,77■■■■□ 3,16
Pkd2O35245 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,77■■■■□ 3,16
Pkd2O35245 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,77■■■■□ 3,16
Pkd2O35245 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,76■■■■□ 3,16
Pkd2O35245 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC34,76■■■■□ 3,16
Pkd2O35245 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,76■■■■□ 3,15
Pkd2O35245 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
Pkd2O35245 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,73■■■■□ 3,15
Pkd2O35245 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
Pkd2O35245 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
Pkd2O35245 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34,72■■■■□ 3,15
Pkd2O35245 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34,72■■■■□ 3,15
Pkd2O35245 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC34,72■■■■□ 3,15
Pkd2O35245 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Pkd2O35245 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Pkd2O35245 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Pkd2O35245 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Pkd2O35245 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Pkd2O35245 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34,7■■■■□ 3,15
Pkd2O35245 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC34,68■■■■□ 3,14
Pkd2O35245 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC34,68■■■■□ 3,14
Pkd2O35245 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,68■■■■□ 3,14
Pkd2O35245 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC34,67■■■■□ 3,14
Pkd2O35245 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
Pkd2O35245 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC34,66■■■■□ 3,14
Pkd2O35245 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC34,66■■■■□ 3,14
Pkd2O35245 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34,66■■■■□ 3,14
Pkd2O35245 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
Pkd2O35245 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,64■■■■□ 3,14
Pkd2O35245 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Pkd2O35245 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Pkd2O35245 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Pkd2O35245 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
Pkd2O35245 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC34,59■■■■□ 3,13
Pkd2O35245 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
Pkd2O35245 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Pkd2O35245 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,58■■■■□ 3,13
Pkd2O35245 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,58■■■■□ 3,13
Pkd2O35245 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
Pkd2O35245 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
Pkd2O35245 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC34,56■■■■□ 3,12
Pkd2O35245 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Pkd2O35245 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Pkd2O35245 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,53■■■■□ 3,12
Pkd2O35245 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
Pkd2O35245 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC34,51■■■■□ 3,12
Pkd2O35245 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC34,5■■■■□ 3,11
Pkd2O35245 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
Pkd2O35245 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
Pkd2O35245 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Pkd2O35245 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
Pkd2O35245 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
Pkd2O35245 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Pkd2O35245 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Pkd2O35245 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC34,46■■■■□ 3,11
Pkd2O35245 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Pkd2O35245 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC34,46■■■■□ 3,11
Pkd2O35245 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,45■■■■□ 3,11
Pkd2O35245 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Pkd2O35245 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC34,44■■■■□ 3,1
Pkd2O35245 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Pkd2O35245 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC34,43■■■■□ 3,1
Pkd2O35245 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Pkd2O35245 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,41■■■■□ 3,1
Pkd2O35245 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Pkd2O35245 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Pkd2O35245 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Pkd2O35245 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,38■■■■□ 3,09
Pkd2O35245 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
Pkd2O35245 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC34,37■■■■□ 3,09
Pkd2O35245 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,1 ms