Protein–RNA interactions for Protein: O35192

Vmn2r42, Putative pheromone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r42O35192 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn2r42O35192 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn2r42O35192 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn2r42O35192 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn2r42O35192 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn2r42O35192 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn2r42O35192 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn2r42O35192 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn2r42O35192 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn2r42O35192 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn2r42O35192 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn2r42O35192 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn2r42O35192 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn2r42O35192 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn2r42O35192 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn2r42O35192 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vmn2r42O35192 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vmn2r42O35192 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn2r42O35192 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn2r42O35192 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn2r42O35192 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn2r42O35192 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn2r42O35192 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn2r42O35192 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn2r42O35192 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn2r42O35192 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn2r42O35192 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn2r42O35192 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn2r42O35192 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn2r42O35192 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn2r42O35192 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn2r42O35192 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn2r42O35192 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn2r42O35192 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn2r42O35192 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn2r42O35192 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn2r42O35192 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn2r42O35192 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn2r42O35192 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn2r42O35192 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn2r42O35192 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vmn2r42O35192 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vmn2r42O35192 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vmn2r42O35192 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn2r42O35192 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn2r42O35192 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn2r42O35192 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn2r42O35192 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn2r42O35192 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn2r42O35192 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn2r42O35192 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn2r42O35192 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn2r42O35192 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn2r42O35192 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn2r42O35192 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn2r42O35192 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn2r42O35192 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn2r42O35192 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn2r42O35192 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn2r42O35192 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn2r42O35192 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn2r42O35192 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn2r42O35192 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn2r42O35192 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn2r42O35192 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn2r42O35192 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn2r42O35192 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn2r42O35192 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vmn2r42O35192 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vmn2r42O35192 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn2r42O35192 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn2r42O35192 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn2r42O35192 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn2r42O35192 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn2r42O35192 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn2r42O35192 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn2r42O35192 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn2r42O35192 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn2r42O35192 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn2r42O35192 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn2r42O35192 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn2r42O35192 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn2r42O35192 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn2r42O35192 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn2r42O35192 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn2r42O35192 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn2r42O35192 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn2r42O35192 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn2r42O35192 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn2r42O35192 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn2r42O35192 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn2r42O35192 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn2r42O35192 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn2r42O35192 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn2r42O35192 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn2r42O35192 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn2r42O35192 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn2r42O35192 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn2r42O35192 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn2r42O35192 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164 ms