Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bhlhe40O35185 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bhlhe40O35185 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bhlhe40O35185 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bhlhe40O35185 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bhlhe40O35185 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bhlhe40O35185 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Bhlhe40O35185 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bhlhe40O35185 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bhlhe40O35185 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Bhlhe40O35185 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bhlhe40O35185 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bhlhe40O35185 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bhlhe40O35185 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bhlhe40O35185 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bhlhe40O35185 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bhlhe40O35185 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bhlhe40O35185 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bhlhe40O35185 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bhlhe40O35185 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bhlhe40O35185 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bhlhe40O35185 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bhlhe40O35185 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bhlhe40O35185 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bhlhe40O35185 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bhlhe40O35185 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bhlhe40O35185 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bhlhe40O35185 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Bhlhe40O35185 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bhlhe40O35185 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bhlhe40O35185 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bhlhe40O35185 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bhlhe40O35185 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bhlhe40O35185 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bhlhe40O35185 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bhlhe40O35185 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bhlhe40O35185 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Bhlhe40O35185 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bhlhe40O35185 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Bhlhe40O35185 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bhlhe40O35185 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bhlhe40O35185 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bhlhe40O35185 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bhlhe40O35185 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bhlhe40O35185 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bhlhe40O35185 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Bhlhe40O35185 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bhlhe40O35185 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bhlhe40O35185 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Bhlhe40O35185 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bhlhe40O35185 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bhlhe40O35185 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bhlhe40O35185 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Bhlhe40O35185 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bhlhe40O35185 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bhlhe40O35185 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bhlhe40O35185 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bhlhe40O35185 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bhlhe40O35185 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bhlhe40O35185 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bhlhe40O35185 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Bhlhe40O35185 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bhlhe40O35185 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bhlhe40O35185 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bhlhe40O35185 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bhlhe40O35185 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bhlhe40O35185 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bhlhe40O35185 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bhlhe40O35185 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bhlhe40O35185 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bhlhe40O35185 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bhlhe40O35185 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bhlhe40O35185 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bhlhe40O35185 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bhlhe40O35185 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bhlhe40O35185 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bhlhe40O35185 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bhlhe40O35185 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bhlhe40O35185 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bhlhe40O35185 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bhlhe40O35185 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bhlhe40O35185 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bhlhe40O35185 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bhlhe40O35185 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bhlhe40O35185 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bhlhe40O35185 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bhlhe40O35185 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bhlhe40O35185 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bhlhe40O35185 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bhlhe40O35185 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bhlhe40O35185 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bhlhe40O35185 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Bhlhe40O35185 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bhlhe40O35185 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bhlhe40O35185 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bhlhe40O35185 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bhlhe40O35185 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bhlhe40O35185 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bhlhe40O35185 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bhlhe40O35185 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms