Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Polr1aO35134 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
Polr1aO35134 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Polr1aO35134 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Polr1aO35134 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Polr1aO35134 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Polr1aO35134 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Polr1aO35134 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Polr1aO35134 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Polr1aO35134 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Polr1aO35134 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
Polr1aO35134 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
Polr1aO35134 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Polr1aO35134 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Polr1aO35134 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Polr1aO35134 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Polr1aO35134 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Polr1aO35134 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Polr1aO35134 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Polr1aO35134 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Polr1aO35134 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Polr1aO35134 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Polr1aO35134 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Polr1aO35134 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
Polr1aO35134 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Polr1aO35134 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Polr1aO35134 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
Polr1aO35134 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Polr1aO35134 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Polr1aO35134 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Polr1aO35134 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Polr1aO35134 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Polr1aO35134 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Polr1aO35134 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Polr1aO35134 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Polr1aO35134 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Polr1aO35134 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Polr1aO35134 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Polr1aO35134 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Polr1aO35134 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Polr1aO35134 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Polr1aO35134 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
Polr1aO35134 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Polr1aO35134 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Polr1aO35134 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Polr1aO35134 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Polr1aO35134 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Polr1aO35134 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Polr1aO35134 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Polr1aO35134 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Polr1aO35134 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Polr1aO35134 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Polr1aO35134 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Polr1aO35134 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Polr1aO35134 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Polr1aO35134 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Polr1aO35134 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Polr1aO35134 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Polr1aO35134 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Polr1aO35134 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Polr1aO35134 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Polr1aO35134 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Polr1aO35134 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Polr1aO35134 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Polr1aO35134 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Polr1aO35134 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Polr1aO35134 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Polr1aO35134 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Polr1aO35134 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Polr1aO35134 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Polr1aO35134 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Polr1aO35134 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Polr1aO35134 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Polr1aO35134 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Polr1aO35134 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Polr1aO35134 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Polr1aO35134 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Polr1aO35134 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Polr1aO35134 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
Polr1aO35134 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Polr1aO35134 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
Polr1aO35134 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Polr1aO35134 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Polr1aO35134 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Polr1aO35134 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Polr1aO35134 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Polr1aO35134 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Polr1aO35134 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Polr1aO35134 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Polr1aO35134 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Polr1aO35134 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
Polr1aO35134 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Polr1aO35134 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
Polr1aO35134 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Polr1aO35134 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Polr1aO35134 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Polr1aO35134 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Polr1aO35134 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Polr1aO35134 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
Polr1aO35134 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms