Protein–RNA interactions for Protein: O09172

Gclm, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GclmO09172 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GclmO09172 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GclmO09172 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GclmO09172 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GclmO09172 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GclmO09172 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GclmO09172 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GclmO09172 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GclmO09172 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GclmO09172 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GclmO09172 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GclmO09172 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GclmO09172 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GclmO09172 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GclmO09172 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GclmO09172 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GclmO09172 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GclmO09172 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GclmO09172 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GclmO09172 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GclmO09172 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GclmO09172 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GclmO09172 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GclmO09172 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GclmO09172 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GclmO09172 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GclmO09172 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GclmO09172 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GclmO09172 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GclmO09172 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GclmO09172 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GclmO09172 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GclmO09172 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GclmO09172 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GclmO09172 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GclmO09172 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GclmO09172 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GclmO09172 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GclmO09172 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GclmO09172 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GclmO09172 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GclmO09172 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GclmO09172 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GclmO09172 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GclmO09172 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GclmO09172 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GclmO09172 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GclmO09172 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GclmO09172 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GclmO09172 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GclmO09172 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GclmO09172 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GclmO09172 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GclmO09172 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GclmO09172 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GclmO09172 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GclmO09172 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GclmO09172 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GclmO09172 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GclmO09172 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GclmO09172 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GclmO09172 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GclmO09172 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GclmO09172 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GclmO09172 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GclmO09172 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GclmO09172 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GclmO09172 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GclmO09172 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GclmO09172 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GclmO09172 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GclmO09172 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GclmO09172 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GclmO09172 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GclmO09172 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GclmO09172 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GclmO09172 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GclmO09172 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GclmO09172 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GclmO09172 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GclmO09172 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GclmO09172 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GclmO09172 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GclmO09172 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GclmO09172 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GclmO09172 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GclmO09172 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GclmO09172 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GclmO09172 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GclmO09172 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GclmO09172 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GclmO09172 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GclmO09172 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26■■□□□ 1.75
GclmO09172 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GclmO09172 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GclmO09172 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GclmO09172 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GclmO09172 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GclmO09172 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GclmO09172 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1140.7 ms