Protein–RNA interactions for Protein: O09167

Rpl21, 60S ribosomal protein L21, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl21O09167 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpl21O09167 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpl21O09167 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpl21O09167 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpl21O09167 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpl21O09167 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl21O09167 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl21O09167 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl21O09167 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpl21O09167 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpl21O09167 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpl21O09167 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpl21O09167 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpl21O09167 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpl21O09167 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rpl21O09167 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpl21O09167 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpl21O09167 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpl21O09167 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpl21O09167 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpl21O09167 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpl21O09167 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpl21O09167 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpl21O09167 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpl21O09167 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpl21O09167 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpl21O09167 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpl21O09167 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpl21O09167 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpl21O09167 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpl21O09167 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpl21O09167 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpl21O09167 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpl21O09167 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpl21O09167 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpl21O09167 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpl21O09167 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpl21O09167 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpl21O09167 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpl21O09167 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpl21O09167 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpl21O09167 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpl21O09167 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpl21O09167 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpl21O09167 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpl21O09167 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpl21O09167 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpl21O09167 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rpl21O09167 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpl21O09167 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpl21O09167 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpl21O09167 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpl21O09167 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpl21O09167 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpl21O09167 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpl21O09167 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpl21O09167 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpl21O09167 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpl21O09167 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpl21O09167 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpl21O09167 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpl21O09167 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpl21O09167 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpl21O09167 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpl21O09167 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpl21O09167 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpl21O09167 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpl21O09167 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpl21O09167 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpl21O09167 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpl21O09167 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpl21O09167 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpl21O09167 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpl21O09167 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpl21O09167 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpl21O09167 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpl21O09167 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpl21O09167 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpl21O09167 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpl21O09167 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpl21O09167 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpl21O09167 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rpl21O09167 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rpl21O09167 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpl21O09167 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpl21O09167 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpl21O09167 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpl21O09167 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpl21O09167 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpl21O09167 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpl21O09167 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpl21O09167 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpl21O09167 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpl21O09167 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpl21O09167 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpl21O09167 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpl21O09167 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpl21O09167 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpl21O09167 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpl21O09167 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms