Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Casq1O09165 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Casq1O09165 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Casq1O09165 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Casq1O09165 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Casq1O09165 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Casq1O09165 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Casq1O09165 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Casq1O09165 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Casq1O09165 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Casq1O09165 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Casq1O09165 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Casq1O09165 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Casq1O09165 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Casq1O09165 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Casq1O09165 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Casq1O09165 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Casq1O09165 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Casq1O09165 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Casq1O09165 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Casq1O09165 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Casq1O09165 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Casq1O09165 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Casq1O09165 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Casq1O09165 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Casq1O09165 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Casq1O09165 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Casq1O09165 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Casq1O09165 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Casq1O09165 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Casq1O09165 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Casq1O09165 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Casq1O09165 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Casq1O09165 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Casq1O09165 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Casq1O09165 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Casq1O09165 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Casq1O09165 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Casq1O09165 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Casq1O09165 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Casq1O09165 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Casq1O09165 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Casq1O09165 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Casq1O09165 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Casq1O09165 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Casq1O09165 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Casq1O09165 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Casq1O09165 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Casq1O09165 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Casq1O09165 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Casq1O09165 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Casq1O09165 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Casq1O09165 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Casq1O09165 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Casq1O09165 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Casq1O09165 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Casq1O09165 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Casq1O09165 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Casq1O09165 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Casq1O09165 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Casq1O09165 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Casq1O09165 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Casq1O09165 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Casq1O09165 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Casq1O09165 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Casq1O09165 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Casq1O09165 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Casq1O09165 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Casq1O09165 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Casq1O09165 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Casq1O09165 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Casq1O09165 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Casq1O09165 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Casq1O09165 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Casq1O09165 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Casq1O09165 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Casq1O09165 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Casq1O09165 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Casq1O09165 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Casq1O09165 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Casq1O09165 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Casq1O09165 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Casq1O09165 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Casq1O09165 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Casq1O09165 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Casq1O09165 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Casq1O09165 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Casq1O09165 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Casq1O09165 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Casq1O09165 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Casq1O09165 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Casq1O09165 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Casq1O09165 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Casq1O09165 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Casq1O09165 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Casq1O09165 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Casq1O09165 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Casq1O09165 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Casq1O09165 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Casq1O09165 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
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