Protein–RNA interactions for Protein: O08739

Ampd3, AMP deaminase 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ampd3O08739 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ampd3O08739 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ampd3O08739 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ampd3O08739 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ampd3O08739 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ampd3O08739 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ampd3O08739 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ampd3O08739 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ampd3O08739 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ampd3O08739 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ampd3O08739 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ampd3O08739 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ampd3O08739 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ampd3O08739 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ampd3O08739 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ampd3O08739 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ampd3O08739 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ampd3O08739 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ampd3O08739 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ampd3O08739 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ampd3O08739 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ampd3O08739 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ampd3O08739 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ampd3O08739 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ampd3O08739 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ampd3O08739 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ampd3O08739 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ampd3O08739 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ampd3O08739 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ampd3O08739 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ampd3O08739 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ampd3O08739 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ampd3O08739 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ampd3O08739 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ampd3O08739 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ampd3O08739 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ampd3O08739 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ampd3O08739 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ampd3O08739 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ampd3O08739 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ampd3O08739 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ampd3O08739 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ampd3O08739 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ampd3O08739 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ampd3O08739 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ampd3O08739 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ampd3O08739 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ampd3O08739 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ampd3O08739 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ampd3O08739 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ampd3O08739 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ampd3O08739 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ampd3O08739 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ampd3O08739 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ampd3O08739 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ampd3O08739 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ampd3O08739 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ampd3O08739 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ampd3O08739 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ampd3O08739 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ampd3O08739 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ampd3O08739 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ampd3O08739 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ampd3O08739 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ampd3O08739 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ampd3O08739 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ampd3O08739 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ampd3O08739 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ampd3O08739 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ampd3O08739 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ampd3O08739 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ampd3O08739 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ampd3O08739 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ampd3O08739 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ampd3O08739 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ampd3O08739 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ampd3O08739 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ampd3O08739 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ampd3O08739 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ampd3O08739 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ampd3O08739 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ampd3O08739 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ampd3O08739 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ampd3O08739 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ampd3O08739 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ampd3O08739 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ampd3O08739 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ampd3O08739 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ampd3O08739 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ampd3O08739 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ampd3O08739 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ampd3O08739 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ampd3O08739 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ampd3O08739 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ampd3O08739 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ampd3O08739 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ampd3O08739 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ampd3O08739 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ampd3O08739 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ampd3O08739 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms