Protein–RNA interactions for Protein: L7N280

Gm21962, Predicted gene, 21962, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21962L7N280 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm21962L7N280 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm21962L7N280 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm21962L7N280 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm21962L7N280 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm21962L7N280 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm21962L7N280 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm21962L7N280 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm21962L7N280 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm21962L7N280 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm21962L7N280 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm21962L7N280 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm21962L7N280 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm21962L7N280 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm21962L7N280 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm21962L7N280 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm21962L7N280 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm21962L7N280 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm21962L7N280 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm21962L7N280 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm21962L7N280 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm21962L7N280 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm21962L7N280 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm21962L7N280 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm21962L7N280 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm21962L7N280 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm21962L7N280 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm21962L7N280 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm21962L7N280 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm21962L7N280 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm21962L7N280 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm21962L7N280 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm21962L7N280 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm21962L7N280 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm21962L7N280 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm21962L7N280 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm21962L7N280 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm21962L7N280 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm21962L7N280 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm21962L7N280 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm21962L7N280 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm21962L7N280 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm21962L7N280 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm21962L7N280 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm21962L7N280 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm21962L7N280 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm21962L7N280 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm21962L7N280 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm21962L7N280 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm21962L7N280 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm21962L7N280 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm21962L7N280 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm21962L7N280 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm21962L7N280 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm21962L7N280 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm21962L7N280 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm21962L7N280 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm21962L7N280 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm21962L7N280 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm21962L7N280 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm21962L7N280 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm21962L7N280 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm21962L7N280 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm21962L7N280 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm21962L7N280 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm21962L7N280 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm21962L7N280 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm21962L7N280 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm21962L7N280 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm21962L7N280 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm21962L7N280 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm21962L7N280 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm21962L7N280 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm21962L7N280 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm21962L7N280 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm21962L7N280 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm21962L7N280 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm21962L7N280 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm21962L7N280 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm21962L7N280 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm21962L7N280 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm21962L7N280 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm21962L7N280 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm21962L7N280 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm21962L7N280 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm21962L7N280 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm21962L7N280 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm21962L7N280 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm21962L7N280 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm21962L7N280 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm21962L7N280 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm21962L7N280 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm21962L7N280 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm21962L7N280 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm21962L7N280 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm21962L7N280 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm21962L7N280 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm21962L7N280 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm21962L7N280 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm21962L7N280 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms