Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc191J3QQ27 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc191J3QQ27 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc191J3QQ27 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc191J3QQ27 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc191J3QQ27 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc191J3QQ27 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc191J3QQ27 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc191J3QQ27 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc191J3QQ27 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc191J3QQ27 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc191J3QQ27 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc191J3QQ27 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc191J3QQ27 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc191J3QQ27 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc191J3QQ27 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc191J3QQ27 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc191J3QQ27 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc191J3QQ27 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc191J3QQ27 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc191J3QQ27 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc191J3QQ27 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc191J3QQ27 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc191J3QQ27 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc191J3QQ27 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc191J3QQ27 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc191J3QQ27 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc191J3QQ27 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc191J3QQ27 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc191J3QQ27 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc191J3QQ27 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc191J3QQ27 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc191J3QQ27 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc191J3QQ27 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc191J3QQ27 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc191J3QQ27 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc191J3QQ27 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc191J3QQ27 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc191J3QQ27 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc191J3QQ27 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc191J3QQ27 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc191J3QQ27 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc191J3QQ27 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc191J3QQ27 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc191J3QQ27 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc191J3QQ27 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc191J3QQ27 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc191J3QQ27 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc191J3QQ27 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc191J3QQ27 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc191J3QQ27 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc191J3QQ27 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc191J3QQ27 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc191J3QQ27 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc191J3QQ27 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc191J3QQ27 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc191J3QQ27 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms