Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
Ccdc180J3QNE4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC45.07■■■■■ 4.81
Ccdc180J3QNE4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
Ccdc180J3QNE4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
Ccdc180J3QNE4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
Ccdc180J3QNE4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC45.04■■■■■ 4.8
Ccdc180J3QNE4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.02■■■■■ 4.8
Ccdc180J3QNE4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC45.02■■■■■ 4.8
Ccdc180J3QNE4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45■■■■■ 4.8
Ccdc180J3QNE4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.8
Ccdc180J3QNE4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC45■■■■■ 4.79
Ccdc180J3QNE4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
Ccdc180J3QNE4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
Ccdc180J3QNE4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
Ccdc180J3QNE4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
Ccdc180J3QNE4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
Ccdc180J3QNE4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.94■■■■■ 4.78
Ccdc180J3QNE4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
Ccdc180J3QNE4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
Ccdc180J3QNE4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
Ccdc180J3QNE4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
Ccdc180J3QNE4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
Ccdc180J3QNE4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC44.88■■■■■ 4.78
Ccdc180J3QNE4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
Ccdc180J3QNE4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
Ccdc180J3QNE4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
Ccdc180J3QNE4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC44.84■■■■■ 4.77
Ccdc180J3QNE4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
Ccdc180J3QNE4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.83■■■■■ 4.77
Ccdc180J3QNE4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC44.83■■■■■ 4.77
Ccdc180J3QNE4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
Ccdc180J3QNE4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
Ccdc180J3QNE4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
Ccdc180J3QNE4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
Ccdc180J3QNE4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.79■■■■■ 4.76
Ccdc180J3QNE4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.79■■■■■ 4.76
Ccdc180J3QNE4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
Ccdc180J3QNE4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC44.79■■■■■ 4.76
Ccdc180J3QNE4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC44.78■■■■■ 4.76
Ccdc180J3QNE4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.77■■■■■ 4.76
Ccdc180J3QNE4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC44.76■■■■■ 4.76
Ccdc180J3QNE4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
Ccdc180J3QNE4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
Ccdc180J3QNE4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
Ccdc180J3QNE4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
Ccdc180J3QNE4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
Ccdc180J3QNE4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC44.73■■■■■ 4.75
Ccdc180J3QNE4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
Ccdc180J3QNE4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
Ccdc180J3QNE4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
Ccdc180J3QNE4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
Ccdc180J3QNE4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC44.68■■■■■ 4.74
Ccdc180J3QNE4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
Ccdc180J3QNE4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC44.67■■■■■ 4.74
Ccdc180J3QNE4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC44.66■■■■■ 4.74
Ccdc180J3QNE4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC44.66■■■■■ 4.74
Ccdc180J3QNE4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
Ccdc180J3QNE4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC44.65■■■■■ 4.74
Ccdc180J3QNE4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC44.64■■■■■ 4.74
Ccdc180J3QNE4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.63■■■■■ 4.73
Ccdc180J3QNE4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
Ccdc180J3QNE4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
Ccdc180J3QNE4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
Ccdc180J3QNE4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
Ccdc180J3QNE4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
Ccdc180J3QNE4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
Ccdc180J3QNE4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
Ccdc180J3QNE4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC44.56■■■■■ 4.72
Ccdc180J3QNE4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
Ccdc180J3QNE4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
Ccdc180J3QNE4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC44.54■■■■■ 4.72
Ccdc180J3QNE4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
Ccdc180J3QNE4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
Ccdc180J3QNE4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
Ccdc180J3QNE4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC44.52■■■■■ 4.72
Ccdc180J3QNE4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC44.51■■■■■ 4.72
Ccdc180J3QNE4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
Ccdc180J3QNE4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
Ccdc180J3QNE4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
Ccdc180J3QNE4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
Ccdc180J3QNE4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
Ccdc180J3QNE4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC44.48■■■■■ 4.71
Ccdc180J3QNE4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
Ccdc180J3QNE4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.45■■■■■ 4.71
Ccdc180J3QNE4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
Ccdc180J3QNE4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
Ccdc180J3QNE4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC44.43■■■■■ 4.7
Ccdc180J3QNE4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC44.42■■■■■ 4.7
Ccdc180J3QNE4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC44.42■■■■■ 4.7
Ccdc180J3QNE4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
Ccdc180J3QNE4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC44.41■■■■■ 4.7
Ccdc180J3QNE4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
Ccdc180J3QNE4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
Ccdc180J3QNE4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.7
Ccdc180J3QNE4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.7
Ccdc180J3QNE4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
Ccdc180J3QNE4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
Ccdc180J3QNE4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
Ccdc180J3QNE4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC44.37■■■■■ 4.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms