Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm20828J3KMI7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm20828J3KMI7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm20828J3KMI7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm20828J3KMI7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm20828J3KMI7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm20828J3KMI7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm20828J3KMI7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm20828J3KMI7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm20828J3KMI7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm20828J3KMI7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm20828J3KMI7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm20828J3KMI7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm20828J3KMI7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm20828J3KMI7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm20828J3KMI7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm20828J3KMI7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm20828J3KMI7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm20828J3KMI7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm20828J3KMI7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm20828J3KMI7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm20828J3KMI7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm20828J3KMI7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm20828J3KMI7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm20828J3KMI7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm20828J3KMI7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm20828J3KMI7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm20828J3KMI7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm20828J3KMI7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm20828J3KMI7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm20828J3KMI7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm20828J3KMI7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm20828J3KMI7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm20828J3KMI7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm20828J3KMI7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm20828J3KMI7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm20828J3KMI7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm20828J3KMI7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm20828J3KMI7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm20828J3KMI7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm20828J3KMI7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm20828J3KMI7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm20828J3KMI7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm20828J3KMI7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm20828J3KMI7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm20828J3KMI7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm20828J3KMI7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm20828J3KMI7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm20828J3KMI7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm20828J3KMI7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm20828J3KMI7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm20828J3KMI7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm20828J3KMI7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm20828J3KMI7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm20828J3KMI7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm20828J3KMI7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm20828J3KMI7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm20828J3KMI7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm20828J3KMI7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm20828J3KMI7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm20828J3KMI7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm20828J3KMI7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm20828J3KMI7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm20828J3KMI7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm20828J3KMI7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm20828J3KMI7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm20828J3KMI7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm20828J3KMI7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm20828J3KMI7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm20828J3KMI7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm20828J3KMI7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm20828J3KMI7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm20828J3KMI7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm20828J3KMI7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm20828J3KMI7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm20828J3KMI7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm20828J3KMI7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm20828J3KMI7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm20828J3KMI7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm20828J3KMI7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm20828J3KMI7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm20828J3KMI7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm20828J3KMI7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm20828J3KMI7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm20828J3KMI7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm20828J3KMI7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm20828J3KMI7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm20828J3KMI7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm20828J3KMI7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm20828J3KMI7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm20828J3KMI7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm20828J3KMI7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm20828J3KMI7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm20828J3KMI7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm20828J3KMI7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm20828J3KMI7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm20828J3KMI7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm20828J3KMI7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm20828J3KMI7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm20828J3KMI7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
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