Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U1

Obox6, Oocyte specific homeobox 6, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox6G3X9U1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Obox6G3X9U1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Obox6G3X9U1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Obox6G3X9U1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Obox6G3X9U1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Obox6G3X9U1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Obox6G3X9U1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Obox6G3X9U1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Obox6G3X9U1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Obox6G3X9U1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Obox6G3X9U1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Obox6G3X9U1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Obox6G3X9U1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Obox6G3X9U1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Obox6G3X9U1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Obox6G3X9U1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Obox6G3X9U1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Obox6G3X9U1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Obox6G3X9U1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Obox6G3X9U1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Obox6G3X9U1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Obox6G3X9U1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Obox6G3X9U1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Obox6G3X9U1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Obox6G3X9U1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Obox6G3X9U1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Obox6G3X9U1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Obox6G3X9U1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Obox6G3X9U1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Obox6G3X9U1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Obox6G3X9U1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Obox6G3X9U1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Obox6G3X9U1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Obox6G3X9U1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Obox6G3X9U1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Obox6G3X9U1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Obox6G3X9U1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Obox6G3X9U1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Obox6G3X9U1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Obox6G3X9U1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Obox6G3X9U1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Obox6G3X9U1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Obox6G3X9U1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Obox6G3X9U1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Obox6G3X9U1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Obox6G3X9U1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Obox6G3X9U1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Obox6G3X9U1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Obox6G3X9U1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Obox6G3X9U1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Obox6G3X9U1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Obox6G3X9U1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Obox6G3X9U1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Obox6G3X9U1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Obox6G3X9U1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Obox6G3X9U1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Obox6G3X9U1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Obox6G3X9U1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Obox6G3X9U1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Obox6G3X9U1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Obox6G3X9U1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Obox6G3X9U1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Obox6G3X9U1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Obox6G3X9U1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Obox6G3X9U1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Obox6G3X9U1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Obox6G3X9U1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Obox6G3X9U1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Obox6G3X9U1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Obox6G3X9U1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Obox6G3X9U1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Obox6G3X9U1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Obox6G3X9U1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Obox6G3X9U1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Obox6G3X9U1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Obox6G3X9U1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Obox6G3X9U1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Obox6G3X9U1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Obox6G3X9U1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Obox6G3X9U1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Obox6G3X9U1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Obox6G3X9U1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Obox6G3X9U1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Obox6G3X9U1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Obox6G3X9U1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Obox6G3X9U1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Obox6G3X9U1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Obox6G3X9U1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Obox6G3X9U1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Obox6G3X9U1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Obox6G3X9U1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Obox6G3X9U1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Obox6G3X9U1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Obox6G3X9U1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Obox6G3X9U1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Obox6G3X9U1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Obox6G3X9U1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Obox6G3X9U1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Obox6G3X9U1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Obox6G3X9U1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms