Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmgxb3G3X9M3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmgxb3G3X9M3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmgxb3G3X9M3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmgxb3G3X9M3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmgxb3G3X9M3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmgxb3G3X9M3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmgxb3G3X9M3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmgxb3G3X9M3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmgxb3G3X9M3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmgxb3G3X9M3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hmgxb3G3X9M3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Hmgxb3G3X9M3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmgxb3G3X9M3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmgxb3G3X9M3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmgxb3G3X9M3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmgxb3G3X9M3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgxb3G3X9M3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgxb3G3X9M3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgxb3G3X9M3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgxb3G3X9M3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgxb3G3X9M3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgxb3G3X9M3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgxb3G3X9M3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgxb3G3X9M3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgxb3G3X9M3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgxb3G3X9M3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgxb3G3X9M3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgxb3G3X9M3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgxb3G3X9M3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgxb3G3X9M3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgxb3G3X9M3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmgxb3G3X9M3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmgxb3G3X9M3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmgxb3G3X9M3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmgxb3G3X9M3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hmgxb3G3X9M3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hmgxb3G3X9M3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgxb3G3X9M3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgxb3G3X9M3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgxb3G3X9M3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgxb3G3X9M3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgxb3G3X9M3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmgxb3G3X9M3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmgxb3G3X9M3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmgxb3G3X9M3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgxb3G3X9M3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgxb3G3X9M3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgxb3G3X9M3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgxb3G3X9M3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgxb3G3X9M3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgxb3G3X9M3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgxb3G3X9M3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgxb3G3X9M3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgxb3G3X9M3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgxb3G3X9M3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgxb3G3X9M3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgxb3G3X9M3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgxb3G3X9M3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmgxb3G3X9M3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmgxb3G3X9M3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmgxb3G3X9M3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Hmgxb3G3X9M3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmgxb3G3X9M3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmgxb3G3X9M3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmgxb3G3X9M3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmgxb3G3X9M3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmgxb3G3X9M3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmgxb3G3X9M3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmgxb3G3X9M3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmgxb3G3X9M3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmgxb3G3X9M3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmgxb3G3X9M3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmgxb3G3X9M3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmgxb3G3X9M3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmgxb3G3X9M3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmgxb3G3X9M3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmgxb3G3X9M3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmgxb3G3X9M3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmgxb3G3X9M3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmgxb3G3X9M3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmgxb3G3X9M3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmgxb3G3X9M3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmgxb3G3X9M3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmgxb3G3X9M3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmgxb3G3X9M3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmgxb3G3X9M3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmgxb3G3X9M3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmgxb3G3X9M3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmgxb3G3X9M3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmgxb3G3X9M3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmgxb3G3X9M3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmgxb3G3X9M3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmgxb3G3X9M3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmgxb3G3X9M3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmgxb3G3X9M3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmgxb3G3X9M3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmgxb3G3X9M3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmgxb3G3X9M3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmgxb3G3X9M3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms