Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sh3tc1G3X9F6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sh3tc1G3X9F6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sh3tc1G3X9F6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sh3tc1G3X9F6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Sh3tc1G3X9F6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sh3tc1G3X9F6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sh3tc1G3X9F6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sh3tc1G3X9F6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sh3tc1G3X9F6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sh3tc1G3X9F6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sh3tc1G3X9F6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sh3tc1G3X9F6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sh3tc1G3X9F6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sh3tc1G3X9F6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sh3tc1G3X9F6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Sh3tc1G3X9F6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sh3tc1G3X9F6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sh3tc1G3X9F6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sh3tc1G3X9F6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sh3tc1G3X9F6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Sh3tc1G3X9F6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sh3tc1G3X9F6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sh3tc1G3X9F6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sh3tc1G3X9F6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Sh3tc1G3X9F6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sh3tc1G3X9F6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sh3tc1G3X9F6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sh3tc1G3X9F6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sh3tc1G3X9F6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sh3tc1G3X9F6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sh3tc1G3X9F6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sh3tc1G3X9F6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sh3tc1G3X9F6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sh3tc1G3X9F6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sh3tc1G3X9F6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sh3tc1G3X9F6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Sh3tc1G3X9F6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sh3tc1G3X9F6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sh3tc1G3X9F6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sh3tc1G3X9F6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sh3tc1G3X9F6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sh3tc1G3X9F6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sh3tc1G3X9F6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sh3tc1G3X9F6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sh3tc1G3X9F6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sh3tc1G3X9F6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sh3tc1G3X9F6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sh3tc1G3X9F6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sh3tc1G3X9F6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sh3tc1G3X9F6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sh3tc1G3X9F6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sh3tc1G3X9F6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Sh3tc1G3X9F6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sh3tc1G3X9F6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sh3tc1G3X9F6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sh3tc1G3X9F6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sh3tc1G3X9F6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sh3tc1G3X9F6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sh3tc1G3X9F6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sh3tc1G3X9F6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sh3tc1G3X9F6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sh3tc1G3X9F6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sh3tc1G3X9F6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sh3tc1G3X9F6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sh3tc1G3X9F6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sh3tc1G3X9F6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sh3tc1G3X9F6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sh3tc1G3X9F6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sh3tc1G3X9F6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sh3tc1G3X9F6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sh3tc1G3X9F6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sh3tc1G3X9F6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sh3tc1G3X9F6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sh3tc1G3X9F6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sh3tc1G3X9F6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sh3tc1G3X9F6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sh3tc1G3X9F6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sh3tc1G3X9F6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sh3tc1G3X9F6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sh3tc1G3X9F6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sh3tc1G3X9F6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sh3tc1G3X9F6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Sh3tc1G3X9F6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sh3tc1G3X9F6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sh3tc1G3X9F6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sh3tc1G3X9F6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sh3tc1G3X9F6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sh3tc1G3X9F6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sh3tc1G3X9F6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sh3tc1G3X9F6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sh3tc1G3X9F6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sh3tc1G3X9F6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sh3tc1G3X9F6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sh3tc1G3X9F6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sh3tc1G3X9F6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sh3tc1G3X9F6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Sh3tc1G3X9F6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Sh3tc1G3X9F6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sh3tc1G3X9F6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms