Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Zkscan2G3X952 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Zkscan2G3X952 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Zkscan2G3X952 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Zkscan2G3X952 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Zkscan2G3X952 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Zkscan2G3X952 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Zkscan2G3X952 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Zkscan2G3X952 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Zkscan2G3X952 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Zkscan2G3X952 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Zkscan2G3X952 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Zkscan2G3X952 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Zkscan2G3X952 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Zkscan2G3X952 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Zkscan2G3X952 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Zkscan2G3X952 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Zkscan2G3X952 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Zkscan2G3X952 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Zkscan2G3X952 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Zkscan2G3X952 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Zkscan2G3X952 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Zkscan2G3X952 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Zkscan2G3X952 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Zkscan2G3X952 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,05■■■□□ 2,24
Zkscan2G3X952 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29,05■■■□□ 2,24
Zkscan2G3X952 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Zkscan2G3X952 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Zkscan2G3X952 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Zkscan2G3X952 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Zkscan2G3X952 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Zkscan2G3X952 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Zkscan2G3X952 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Zkscan2G3X952 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Zkscan2G3X952 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,24
Zkscan2G3X952 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,01■■■□□ 2,24
Zkscan2G3X952 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Zkscan2G3X952 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29,01■■■□□ 2,23
Zkscan2G3X952 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Zkscan2G3X952 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Zkscan2G3X952 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Zkscan2G3X952 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Zkscan2G3X952 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Zkscan2G3X952 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Zkscan2G3X952 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Zkscan2G3X952 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Zkscan2G3X952 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Zkscan2G3X952 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Zkscan2G3X952 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Zkscan2G3X952 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Zkscan2G3X952 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Zkscan2G3X952 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Zkscan2G3X952 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Zkscan2G3X952 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28,95■■■□□ 2,23
Zkscan2G3X952 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28,95■■■□□ 2,22
Zkscan2G3X952 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Zkscan2G3X952 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,95■■■□□ 2,22
Zkscan2G3X952 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,95■■■□□ 2,22
Zkscan2G3X952 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Zkscan2G3X952 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Zkscan2G3X952 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Zkscan2G3X952 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Zkscan2G3X952 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Zkscan2G3X952 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Zkscan2G3X952 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Zkscan2G3X952 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Zkscan2G3X952 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Zkscan2G3X952 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Zkscan2G3X952 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Zkscan2G3X952 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Zkscan2G3X952 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Zkscan2G3X952 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Zkscan2G3X952 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Zkscan2G3X952 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Zkscan2G3X952 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Zkscan2G3X952 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Zkscan2G3X952 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Zkscan2G3X952 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Zkscan2G3X952 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Zkscan2G3X952 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Zkscan2G3X952 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Zkscan2G3X952 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Zkscan2G3X952 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Zkscan2G3X952 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Zkscan2G3X952 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Zkscan2G3X952 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Zkscan2G3X952 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Zkscan2G3X952 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Zkscan2G3X952 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Zkscan2G3X952 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Zkscan2G3X952 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Zkscan2G3X952 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28,83■■■□□ 2,21
Zkscan2G3X952 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Zkscan2G3X952 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Zkscan2G3X952 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Zkscan2G3X952 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Zkscan2G3X952 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Zkscan2G3X952 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28,8■■■□□ 2,2
Zkscan2G3X952 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Zkscan2G3X952 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,8■■■□□ 2,2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,3 ms