Protein–RNA interactions for Protein: G3X8U3

2210016F16Rik, MCG6895, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210016F16RikG3X8U3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
2210016F16RikG3X8U3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
2210016F16RikG3X8U3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
2210016F16RikG3X8U3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
2210016F16RikG3X8U3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
2210016F16RikG3X8U3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
2210016F16RikG3X8U3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
2210016F16RikG3X8U3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
2210016F16RikG3X8U3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
2210016F16RikG3X8U3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
2210016F16RikG3X8U3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
2210016F16RikG3X8U3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
2210016F16RikG3X8U3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
2210016F16RikG3X8U3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
2210016F16RikG3X8U3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
2210016F16RikG3X8U3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
2210016F16RikG3X8U3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
2210016F16RikG3X8U3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
2210016F16RikG3X8U3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
2210016F16RikG3X8U3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
2210016F16RikG3X8U3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
2210016F16RikG3X8U3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
2210016F16RikG3X8U3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
2210016F16RikG3X8U3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
2210016F16RikG3X8U3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
2210016F16RikG3X8U3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
2210016F16RikG3X8U3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
2210016F16RikG3X8U3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
2210016F16RikG3X8U3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
2210016F16RikG3X8U3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
2210016F16RikG3X8U3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
2210016F16RikG3X8U3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
2210016F16RikG3X8U3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
2210016F16RikG3X8U3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
2210016F16RikG3X8U3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
2210016F16RikG3X8U3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
2210016F16RikG3X8U3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
2210016F16RikG3X8U3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
2210016F16RikG3X8U3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
2210016F16RikG3X8U3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
2210016F16RikG3X8U3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
2210016F16RikG3X8U3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
2210016F16RikG3X8U3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
2210016F16RikG3X8U3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
2210016F16RikG3X8U3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
2210016F16RikG3X8U3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
2210016F16RikG3X8U3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
2210016F16RikG3X8U3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
2210016F16RikG3X8U3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
2210016F16RikG3X8U3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
2210016F16RikG3X8U3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
2210016F16RikG3X8U3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
2210016F16RikG3X8U3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
2210016F16RikG3X8U3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
2210016F16RikG3X8U3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
2210016F16RikG3X8U3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
2210016F16RikG3X8U3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
2210016F16RikG3X8U3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
2210016F16RikG3X8U3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
2210016F16RikG3X8U3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
2210016F16RikG3X8U3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
2210016F16RikG3X8U3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
2210016F16RikG3X8U3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
2210016F16RikG3X8U3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
2210016F16RikG3X8U3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
2210016F16RikG3X8U3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
2210016F16RikG3X8U3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
2210016F16RikG3X8U3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
2210016F16RikG3X8U3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
2210016F16RikG3X8U3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
2210016F16RikG3X8U3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
2210016F16RikG3X8U3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
2210016F16RikG3X8U3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
2210016F16RikG3X8U3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
2210016F16RikG3X8U3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
2210016F16RikG3X8U3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
2210016F16RikG3X8U3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
2210016F16RikG3X8U3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
2210016F16RikG3X8U3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
2210016F16RikG3X8U3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
2210016F16RikG3X8U3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
2210016F16RikG3X8U3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
2210016F16RikG3X8U3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
2210016F16RikG3X8U3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
2210016F16RikG3X8U3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
2210016F16RikG3X8U3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
2210016F16RikG3X8U3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
2210016F16RikG3X8U3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
2210016F16RikG3X8U3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
2210016F16RikG3X8U3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
2210016F16RikG3X8U3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
2210016F16RikG3X8U3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
2210016F16RikG3X8U3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
2210016F16RikG3X8U3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
2210016F16RikG3X8U3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
2210016F16RikG3X8U3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
2210016F16RikG3X8U3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
2210016F16RikG3X8U3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
2210016F16RikG3X8U3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
2210016F16RikG3X8U3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms