Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nkx1-1G3UXB3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nkx1-1G3UXB3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nkx1-1G3UXB3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nkx1-1G3UXB3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nkx1-1G3UXB3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nkx1-1G3UXB3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nkx1-1G3UXB3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nkx1-1G3UXB3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nkx1-1G3UXB3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nkx1-1G3UXB3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nkx1-1G3UXB3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Nkx1-1G3UXB3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nkx1-1G3UXB3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nkx1-1G3UXB3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nkx1-1G3UXB3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nkx1-1G3UXB3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Nkx1-1G3UXB3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nkx1-1G3UXB3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Nkx1-1G3UXB3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Nkx1-1G3UXB3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nkx1-1G3UXB3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Nkx1-1G3UXB3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nkx1-1G3UXB3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nkx1-1G3UXB3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nkx1-1G3UXB3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Nkx1-1G3UXB3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nkx1-1G3UXB3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nkx1-1G3UXB3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nkx1-1G3UXB3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nkx1-1G3UXB3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nkx1-1G3UXB3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nkx1-1G3UXB3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Nkx1-1G3UXB3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nkx1-1G3UXB3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nkx1-1G3UXB3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nkx1-1G3UXB3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nkx1-1G3UXB3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nkx1-1G3UXB3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nkx1-1G3UXB3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nkx1-1G3UXB3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nkx1-1G3UXB3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nkx1-1G3UXB3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nkx1-1G3UXB3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nkx1-1G3UXB3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nkx1-1G3UXB3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nkx1-1G3UXB3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nkx1-1G3UXB3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nkx1-1G3UXB3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nkx1-1G3UXB3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nkx1-1G3UXB3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nkx1-1G3UXB3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nkx1-1G3UXB3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nkx1-1G3UXB3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nkx1-1G3UXB3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nkx1-1G3UXB3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nkx1-1G3UXB3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nkx1-1G3UXB3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nkx1-1G3UXB3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nkx1-1G3UXB3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nkx1-1G3UXB3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nkx1-1G3UXB3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nkx1-1G3UXB3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nkx1-1G3UXB3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nkx1-1G3UXB3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nkx1-1G3UXB3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nkx1-1G3UXB3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nkx1-1G3UXB3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nkx1-1G3UXB3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nkx1-1G3UXB3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nkx1-1G3UXB3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nkx1-1G3UXB3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nkx1-1G3UXB3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nkx1-1G3UXB3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Nkx1-1G3UXB3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nkx1-1G3UXB3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nkx1-1G3UXB3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nkx1-1G3UXB3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Nkx1-1G3UXB3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nkx1-1G3UXB3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nkx1-1G3UXB3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nkx1-1G3UXB3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nkx1-1G3UXB3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nkx1-1G3UXB3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nkx1-1G3UXB3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nkx1-1G3UXB3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nkx1-1G3UXB3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nkx1-1G3UXB3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nkx1-1G3UXB3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Nkx1-1G3UXB3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nkx1-1G3UXB3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Nkx1-1G3UXB3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nkx1-1G3UXB3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nkx1-1G3UXB3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nkx1-1G3UXB3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nkx1-1G3UXB3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Nkx1-1G3UXB3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nkx1-1G3UXB3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nkx1-1G3UXB3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms