Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE2

F830016B08Rik, Interferon-gamma-inducible GTPase Ifgga4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F830016B08RikG3UWE2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
F830016B08RikG3UWE2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
F830016B08RikG3UWE2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
F830016B08RikG3UWE2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
F830016B08RikG3UWE2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
F830016B08RikG3UWE2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
F830016B08RikG3UWE2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
F830016B08RikG3UWE2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
F830016B08RikG3UWE2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
F830016B08RikG3UWE2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
F830016B08RikG3UWE2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F830016B08RikG3UWE2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F830016B08RikG3UWE2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
F830016B08RikG3UWE2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F830016B08RikG3UWE2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
F830016B08RikG3UWE2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
F830016B08RikG3UWE2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F830016B08RikG3UWE2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F830016B08RikG3UWE2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F830016B08RikG3UWE2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
F830016B08RikG3UWE2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
F830016B08RikG3UWE2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
F830016B08RikG3UWE2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
F830016B08RikG3UWE2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
F830016B08RikG3UWE2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
F830016B08RikG3UWE2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
F830016B08RikG3UWE2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
F830016B08RikG3UWE2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
F830016B08RikG3UWE2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F830016B08RikG3UWE2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F830016B08RikG3UWE2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F830016B08RikG3UWE2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
F830016B08RikG3UWE2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F830016B08RikG3UWE2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F830016B08RikG3UWE2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
F830016B08RikG3UWE2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
F830016B08RikG3UWE2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
F830016B08RikG3UWE2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
F830016B08RikG3UWE2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
F830016B08RikG3UWE2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
F830016B08RikG3UWE2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
F830016B08RikG3UWE2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
F830016B08RikG3UWE2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
F830016B08RikG3UWE2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
F830016B08RikG3UWE2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
F830016B08RikG3UWE2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
F830016B08RikG3UWE2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
F830016B08RikG3UWE2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
F830016B08RikG3UWE2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F830016B08RikG3UWE2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F830016B08RikG3UWE2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F830016B08RikG3UWE2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
F830016B08RikG3UWE2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
F830016B08RikG3UWE2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
F830016B08RikG3UWE2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
F830016B08RikG3UWE2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
F830016B08RikG3UWE2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
F830016B08RikG3UWE2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
F830016B08RikG3UWE2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
F830016B08RikG3UWE2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
F830016B08RikG3UWE2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
F830016B08RikG3UWE2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
F830016B08RikG3UWE2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
F830016B08RikG3UWE2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
F830016B08RikG3UWE2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
F830016B08RikG3UWE2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
F830016B08RikG3UWE2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
F830016B08RikG3UWE2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
F830016B08RikG3UWE2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
F830016B08RikG3UWE2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
F830016B08RikG3UWE2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
F830016B08RikG3UWE2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
F830016B08RikG3UWE2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
F830016B08RikG3UWE2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
F830016B08RikG3UWE2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
F830016B08RikG3UWE2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
F830016B08RikG3UWE2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
F830016B08RikG3UWE2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
F830016B08RikG3UWE2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
F830016B08RikG3UWE2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
F830016B08RikG3UWE2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
F830016B08RikG3UWE2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
F830016B08RikG3UWE2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
F830016B08RikG3UWE2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
F830016B08RikG3UWE2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
F830016B08RikG3UWE2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
F830016B08RikG3UWE2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
F830016B08RikG3UWE2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
F830016B08RikG3UWE2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
F830016B08RikG3UWE2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
F830016B08RikG3UWE2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
F830016B08RikG3UWE2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
F830016B08RikG3UWE2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
F830016B08RikG3UWE2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
F830016B08RikG3UWE2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
F830016B08RikG3UWE2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
F830016B08RikG3UWE2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
F830016B08RikG3UWE2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
F830016B08RikG3UWE2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
F830016B08RikG3UWE2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms