Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NpcdF8VQB8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NpcdF8VQB8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NpcdF8VQB8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NpcdF8VQB8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NpcdF8VQB8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NpcdF8VQB8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NpcdF8VQB8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NpcdF8VQB8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NpcdF8VQB8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NpcdF8VQB8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NpcdF8VQB8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NpcdF8VQB8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NpcdF8VQB8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NpcdF8VQB8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NpcdF8VQB8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NpcdF8VQB8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NpcdF8VQB8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NpcdF8VQB8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NpcdF8VQB8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NpcdF8VQB8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NpcdF8VQB8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NpcdF8VQB8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NpcdF8VQB8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NpcdF8VQB8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NpcdF8VQB8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NpcdF8VQB8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NpcdF8VQB8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NpcdF8VQB8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NpcdF8VQB8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NpcdF8VQB8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NpcdF8VQB8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NpcdF8VQB8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NpcdF8VQB8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NpcdF8VQB8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NpcdF8VQB8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NpcdF8VQB8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NpcdF8VQB8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NpcdF8VQB8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NpcdF8VQB8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NpcdF8VQB8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NpcdF8VQB8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NpcdF8VQB8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NpcdF8VQB8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NpcdF8VQB8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NpcdF8VQB8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NpcdF8VQB8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NpcdF8VQB8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NpcdF8VQB8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NpcdF8VQB8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NpcdF8VQB8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NpcdF8VQB8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NpcdF8VQB8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NpcdF8VQB8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NpcdF8VQB8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NpcdF8VQB8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NpcdF8VQB8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NpcdF8VQB8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NpcdF8VQB8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NpcdF8VQB8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NpcdF8VQB8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NpcdF8VQB8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NpcdF8VQB8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NpcdF8VQB8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NpcdF8VQB8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NpcdF8VQB8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NpcdF8VQB8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NpcdF8VQB8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NpcdF8VQB8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NpcdF8VQB8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NpcdF8VQB8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NpcdF8VQB8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NpcdF8VQB8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NpcdF8VQB8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NpcdF8VQB8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NpcdF8VQB8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NpcdF8VQB8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NpcdF8VQB8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NpcdF8VQB8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NpcdF8VQB8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NpcdF8VQB8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NpcdF8VQB8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NpcdF8VQB8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NpcdF8VQB8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NpcdF8VQB8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NpcdF8VQB8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NpcdF8VQB8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NpcdF8VQB8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NpcdF8VQB8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NpcdF8VQB8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NpcdF8VQB8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NpcdF8VQB8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NpcdF8VQB8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NpcdF8VQB8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NpcdF8VQB8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NpcdF8VQB8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NpcdF8VQB8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NpcdF8VQB8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NpcdF8VQB8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NpcdF8VQB8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms