Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC43.31■■■■■ 4.52
Ercc6F8VPZ5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
Ercc6F8VPZ5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
Ercc6F8VPZ5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
Ercc6F8VPZ5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC43.28■■■■■ 4.52
Ercc6F8VPZ5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
Ercc6F8VPZ5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC43.25■■■■■ 4.51
Ercc6F8VPZ5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
Ercc6F8VPZ5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
Ercc6F8VPZ5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
Ercc6F8VPZ5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
Ercc6F8VPZ5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Ercc6F8VPZ5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC43.22■■■■■ 4.51
Ercc6F8VPZ5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
Ercc6F8VPZ5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
Ercc6F8VPZ5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
Ercc6F8VPZ5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
Ercc6F8VPZ5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC43.19■■■■■ 4.51
Ercc6F8VPZ5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
Ercc6F8VPZ5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
Ercc6F8VPZ5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
Ercc6F8VPZ5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
Ercc6F8VPZ5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
Ercc6F8VPZ5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC43.17■■■■■ 4.5
Ercc6F8VPZ5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
Ercc6F8VPZ5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Ercc6F8VPZ5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC43.16■■■■■ 4.5
Ercc6F8VPZ5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC43.16■■■■■ 4.5
Ercc6F8VPZ5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Ercc6F8VPZ5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
Ercc6F8VPZ5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
Ercc6F8VPZ5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC43.13■■■■■ 4.49
Ercc6F8VPZ5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
Ercc6F8VPZ5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
Ercc6F8VPZ5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
Ercc6F8VPZ5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
Ercc6F8VPZ5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
Ercc6F8VPZ5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
Ercc6F8VPZ5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
Ercc6F8VPZ5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
Ercc6F8VPZ5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
Ercc6F8VPZ5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
Ercc6F8VPZ5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
Ercc6F8VPZ5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
Ercc6F8VPZ5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC43.05■■■■■ 4.48
Ercc6F8VPZ5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC43.04■■■■■ 4.48
Ercc6F8VPZ5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
Ercc6F8VPZ5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
Ercc6F8VPZ5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
Ercc6F8VPZ5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Ercc6F8VPZ5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Ercc6F8VPZ5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
Ercc6F8VPZ5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
Ercc6F8VPZ5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
Ercc6F8VPZ5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43■■■■■ 4.47
Ercc6F8VPZ5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
Ercc6F8VPZ5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
Ercc6F8VPZ5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
Ercc6F8VPZ5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
Ercc6F8VPZ5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC42.94■■■■■ 4.47
Ercc6F8VPZ5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC42.94■■■■■ 4.47
Ercc6F8VPZ5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.93■■■■■ 4.46
Ercc6F8VPZ5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC42.93■■■■■ 4.46
Ercc6F8VPZ5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
Ercc6F8VPZ5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
Ercc6F8VPZ5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
Ercc6F8VPZ5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
Ercc6F8VPZ5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
Ercc6F8VPZ5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
Ercc6F8VPZ5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
Ercc6F8VPZ5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
Ercc6F8VPZ5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
Ercc6F8VPZ5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
Ercc6F8VPZ5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
Ercc6F8VPZ5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
Ercc6F8VPZ5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
Ercc6F8VPZ5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
Ercc6F8VPZ5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC42.8■■■■■ 4.44
Ercc6F8VPZ5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Ercc6F8VPZ5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Ercc6F8VPZ5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC42.78■■■■■ 4.44
Ercc6F8VPZ5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Ercc6F8VPZ5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC42.76■■■■■ 4.44
Ercc6F8VPZ5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
Ercc6F8VPZ5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Ercc6F8VPZ5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Ercc6F8VPZ5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
Ercc6F8VPZ5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
Ercc6F8VPZ5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
Ercc6F8VPZ5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
Ercc6F8VPZ5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC42.7■■■■■ 4.43
Ercc6F8VPZ5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC42.69■■■■■ 4.42
Ercc6F8VPZ5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
Ercc6F8VPZ5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC42.68■■■■■ 4.42
Ercc6F8VPZ5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
Ercc6F8VPZ5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
Ercc6F8VPZ5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
Ercc6F8VPZ5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
Ercc6F8VPZ5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
Ercc6F8VPZ5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms