Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LctF8VPT3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
LctF8VPT3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
LctF8VPT3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LctF8VPT3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LctF8VPT3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LctF8VPT3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LctF8VPT3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LctF8VPT3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LctF8VPT3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LctF8VPT3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LctF8VPT3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LctF8VPT3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LctF8VPT3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LctF8VPT3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LctF8VPT3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LctF8VPT3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LctF8VPT3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LctF8VPT3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LctF8VPT3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LctF8VPT3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LctF8VPT3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LctF8VPT3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LctF8VPT3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LctF8VPT3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LctF8VPT3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LctF8VPT3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LctF8VPT3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LctF8VPT3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LctF8VPT3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LctF8VPT3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LctF8VPT3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LctF8VPT3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LctF8VPT3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LctF8VPT3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LctF8VPT3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LctF8VPT3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LctF8VPT3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LctF8VPT3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LctF8VPT3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LctF8VPT3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LctF8VPT3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LctF8VPT3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LctF8VPT3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LctF8VPT3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LctF8VPT3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LctF8VPT3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LctF8VPT3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LctF8VPT3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LctF8VPT3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LctF8VPT3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LctF8VPT3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LctF8VPT3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LctF8VPT3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LctF8VPT3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LctF8VPT3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LctF8VPT3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LctF8VPT3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LctF8VPT3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LctF8VPT3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LctF8VPT3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LctF8VPT3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LctF8VPT3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LctF8VPT3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LctF8VPT3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LctF8VPT3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LctF8VPT3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LctF8VPT3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LctF8VPT3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LctF8VPT3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LctF8VPT3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LctF8VPT3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LctF8VPT3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LctF8VPT3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LctF8VPT3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LctF8VPT3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LctF8VPT3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LctF8VPT3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LctF8VPT3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LctF8VPT3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LctF8VPT3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LctF8VPT3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LctF8VPT3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LctF8VPT3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LctF8VPT3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LctF8VPT3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LctF8VPT3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LctF8VPT3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LctF8VPT3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LctF8VPT3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LctF8VPT3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LctF8VPT3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LctF8VPT3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LctF8VPT3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LctF8VPT3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LctF8VPT3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LctF8VPT3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LctF8VPT3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LctF8VPT3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LctF8VPT3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms