Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
D430041D05RikF6ZGR6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
D430041D05RikF6ZGR6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
D430041D05RikF6ZGR6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
D430041D05RikF6ZGR6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
D430041D05RikF6ZGR6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
D430041D05RikF6ZGR6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
D430041D05RikF6ZGR6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
D430041D05RikF6ZGR6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
D430041D05RikF6ZGR6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
D430041D05RikF6ZGR6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
D430041D05RikF6ZGR6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
D430041D05RikF6ZGR6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
D430041D05RikF6ZGR6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
D430041D05RikF6ZGR6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
D430041D05RikF6ZGR6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
D430041D05RikF6ZGR6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
D430041D05RikF6ZGR6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
D430041D05RikF6ZGR6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
D430041D05RikF6ZGR6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
D430041D05RikF6ZGR6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
D430041D05RikF6ZGR6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
D430041D05RikF6ZGR6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
D430041D05RikF6ZGR6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
D430041D05RikF6ZGR6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
D430041D05RikF6ZGR6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
D430041D05RikF6ZGR6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
D430041D05RikF6ZGR6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
D430041D05RikF6ZGR6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
D430041D05RikF6ZGR6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
D430041D05RikF6ZGR6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
D430041D05RikF6ZGR6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
D430041D05RikF6ZGR6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
D430041D05RikF6ZGR6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
D430041D05RikF6ZGR6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
D430041D05RikF6ZGR6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
D430041D05RikF6ZGR6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
D430041D05RikF6ZGR6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
D430041D05RikF6ZGR6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
D430041D05RikF6ZGR6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
D430041D05RikF6ZGR6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
D430041D05RikF6ZGR6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
D430041D05RikF6ZGR6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
D430041D05RikF6ZGR6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
D430041D05RikF6ZGR6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
D430041D05RikF6ZGR6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
D430041D05RikF6ZGR6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
D430041D05RikF6ZGR6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
D430041D05RikF6ZGR6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
D430041D05RikF6ZGR6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
D430041D05RikF6ZGR6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
D430041D05RikF6ZGR6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
D430041D05RikF6ZGR6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
D430041D05RikF6ZGR6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
D430041D05RikF6ZGR6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
D430041D05RikF6ZGR6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
D430041D05RikF6ZGR6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
D430041D05RikF6ZGR6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
D430041D05RikF6ZGR6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
D430041D05RikF6ZGR6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
D430041D05RikF6ZGR6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
D430041D05RikF6ZGR6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
D430041D05RikF6ZGR6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
D430041D05RikF6ZGR6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
D430041D05RikF6ZGR6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
D430041D05RikF6ZGR6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
D430041D05RikF6ZGR6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
D430041D05RikF6ZGR6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
D430041D05RikF6ZGR6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
D430041D05RikF6ZGR6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
D430041D05RikF6ZGR6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
D430041D05RikF6ZGR6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
D430041D05RikF6ZGR6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
D430041D05RikF6ZGR6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
D430041D05RikF6ZGR6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
D430041D05RikF6ZGR6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
D430041D05RikF6ZGR6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
D430041D05RikF6ZGR6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
D430041D05RikF6ZGR6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
D430041D05RikF6ZGR6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
D430041D05RikF6ZGR6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
D430041D05RikF6ZGR6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
D430041D05RikF6ZGR6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
D430041D05RikF6ZGR6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
D430041D05RikF6ZGR6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
D430041D05RikF6ZGR6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
D430041D05RikF6ZGR6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
D430041D05RikF6ZGR6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms