Protein–RNA interactions for Protein: F6VUT6

Gm8251, Predicted gene 8251, mousemouse

Predictions only

Length 1,994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8251F6VUT6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8251F6VUT6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8251F6VUT6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8251F6VUT6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8251F6VUT6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8251F6VUT6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8251F6VUT6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8251F6VUT6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm8251F6VUT6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8251F6VUT6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8251F6VUT6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8251F6VUT6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8251F6VUT6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8251F6VUT6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8251F6VUT6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8251F6VUT6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8251F6VUT6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8251F6VUT6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8251F6VUT6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8251F6VUT6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8251F6VUT6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8251F6VUT6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8251F6VUT6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm8251F6VUT6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm8251F6VUT6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm8251F6VUT6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm8251F6VUT6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8251F6VUT6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8251F6VUT6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8251F6VUT6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8251F6VUT6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm8251F6VUT6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8251F6VUT6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8251F6VUT6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8251F6VUT6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8251F6VUT6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8251F6VUT6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8251F6VUT6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8251F6VUT6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8251F6VUT6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8251F6VUT6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8251F6VUT6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8251F6VUT6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8251F6VUT6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm8251F6VUT6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm8251F6VUT6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8251F6VUT6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8251F6VUT6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8251F6VUT6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm8251F6VUT6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm8251F6VUT6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8251F6VUT6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm8251F6VUT6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8251F6VUT6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8251F6VUT6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8251F6VUT6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8251F6VUT6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8251F6VUT6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8251F6VUT6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8251F6VUT6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8251F6VUT6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm8251F6VUT6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8251F6VUT6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8251F6VUT6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm8251F6VUT6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm8251F6VUT6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8251F6VUT6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8251F6VUT6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8251F6VUT6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8251F6VUT6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8251F6VUT6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm8251F6VUT6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm8251F6VUT6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm8251F6VUT6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8251F6VUT6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8251F6VUT6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8251F6VUT6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8251F6VUT6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8251F6VUT6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8251F6VUT6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8251F6VUT6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8251F6VUT6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8251F6VUT6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8251F6VUT6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8251F6VUT6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8251F6VUT6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8251F6VUT6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8251F6VUT6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8251F6VUT6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8251F6VUT6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm8251F6VUT6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8251F6VUT6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8251F6VUT6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8251F6VUT6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8251F6VUT6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8251F6VUT6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8251F6VUT6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8251F6VUT6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8251F6VUT6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8251F6VUT6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms