Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933403O08RikF6UK53 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933403O08RikF6UK53 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
4933403O08RikF6UK53 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933403O08RikF6UK53 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933403O08RikF6UK53 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933403O08RikF6UK53 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933403O08RikF6UK53 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933403O08RikF6UK53 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933403O08RikF6UK53 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4933403O08RikF6UK53 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4933403O08RikF6UK53 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4933403O08RikF6UK53 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4933403O08RikF6UK53 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4933403O08RikF6UK53 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933403O08RikF6UK53 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933403O08RikF6UK53 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933403O08RikF6UK53 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
4933403O08RikF6UK53 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933403O08RikF6UK53 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933403O08RikF6UK53 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933403O08RikF6UK53 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933403O08RikF6UK53 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
4933403O08RikF6UK53 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933403O08RikF6UK53 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
4933403O08RikF6UK53 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4933403O08RikF6UK53 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933403O08RikF6UK53 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933403O08RikF6UK53 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933403O08RikF6UK53 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
4933403O08RikF6UK53 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933403O08RikF6UK53 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933403O08RikF6UK53 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933403O08RikF6UK53 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933403O08RikF6UK53 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933403O08RikF6UK53 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933403O08RikF6UK53 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933403O08RikF6UK53 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933403O08RikF6UK53 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933403O08RikF6UK53 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933403O08RikF6UK53 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933403O08RikF6UK53 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933403O08RikF6UK53 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933403O08RikF6UK53 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933403O08RikF6UK53 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933403O08RikF6UK53 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933403O08RikF6UK53 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933403O08RikF6UK53 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933403O08RikF6UK53 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933403O08RikF6UK53 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
4933403O08RikF6UK53 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933403O08RikF6UK53 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933403O08RikF6UK53 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933403O08RikF6UK53 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
4933403O08RikF6UK53 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4933403O08RikF6UK53 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
4933403O08RikF6UK53 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933403O08RikF6UK53 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933403O08RikF6UK53 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933403O08RikF6UK53 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933403O08RikF6UK53 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933403O08RikF6UK53 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933403O08RikF6UK53 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933403O08RikF6UK53 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933403O08RikF6UK53 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933403O08RikF6UK53 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933403O08RikF6UK53 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933403O08RikF6UK53 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933403O08RikF6UK53 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933403O08RikF6UK53 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933403O08RikF6UK53 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933403O08RikF6UK53 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933403O08RikF6UK53 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933403O08RikF6UK53 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933403O08RikF6UK53 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933403O08RikF6UK53 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
4933403O08RikF6UK53 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933403O08RikF6UK53 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933403O08RikF6UK53 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933403O08RikF6UK53 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933403O08RikF6UK53 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
4933403O08RikF6UK53 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933403O08RikF6UK53 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933403O08RikF6UK53 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933403O08RikF6UK53 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933403O08RikF6UK53 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933403O08RikF6UK53 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933403O08RikF6UK53 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933403O08RikF6UK53 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933403O08RikF6UK53 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933403O08RikF6UK53 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4933403O08RikF6UK53 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4933403O08RikF6UK53 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4933403O08RikF6UK53 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4933403O08RikF6UK53 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4933403O08RikF6UK53 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
4933403O08RikF6UK53 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
4933403O08RikF6UK53 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4933403O08RikF6UK53 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4933403O08RikF6UK53 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms