Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Syngap1F6SEU4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Syngap1F6SEU4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Syngap1F6SEU4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Syngap1F6SEU4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Syngap1F6SEU4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Syngap1F6SEU4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Syngap1F6SEU4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Syngap1F6SEU4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Syngap1F6SEU4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Syngap1F6SEU4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Syngap1F6SEU4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Syngap1F6SEU4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Syngap1F6SEU4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Syngap1F6SEU4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Syngap1F6SEU4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Syngap1F6SEU4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Syngap1F6SEU4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Syngap1F6SEU4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Syngap1F6SEU4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Syngap1F6SEU4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Syngap1F6SEU4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Syngap1F6SEU4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Syngap1F6SEU4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Syngap1F6SEU4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Syngap1F6SEU4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Syngap1F6SEU4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Syngap1F6SEU4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Syngap1F6SEU4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Syngap1F6SEU4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Syngap1F6SEU4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Syngap1F6SEU4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Syngap1F6SEU4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Syngap1F6SEU4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Syngap1F6SEU4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Syngap1F6SEU4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Syngap1F6SEU4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Syngap1F6SEU4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Syngap1F6SEU4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Syngap1F6SEU4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Syngap1F6SEU4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Syngap1F6SEU4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Syngap1F6SEU4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Syngap1F6SEU4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Syngap1F6SEU4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Syngap1F6SEU4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Syngap1F6SEU4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Syngap1F6SEU4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Syngap1F6SEU4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Syngap1F6SEU4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Syngap1F6SEU4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Syngap1F6SEU4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Syngap1F6SEU4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Syngap1F6SEU4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Syngap1F6SEU4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Syngap1F6SEU4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Syngap1F6SEU4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Syngap1F6SEU4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Syngap1F6SEU4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Syngap1F6SEU4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Syngap1F6SEU4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Syngap1F6SEU4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Syngap1F6SEU4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Syngap1F6SEU4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Syngap1F6SEU4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Syngap1F6SEU4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Syngap1F6SEU4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Syngap1F6SEU4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Syngap1F6SEU4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Syngap1F6SEU4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Syngap1F6SEU4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Syngap1F6SEU4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Syngap1F6SEU4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Syngap1F6SEU4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Syngap1F6SEU4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Syngap1F6SEU4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Syngap1F6SEU4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Syngap1F6SEU4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Syngap1F6SEU4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Syngap1F6SEU4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Syngap1F6SEU4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Syngap1F6SEU4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Syngap1F6SEU4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Syngap1F6SEU4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Syngap1F6SEU4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Syngap1F6SEU4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Syngap1F6SEU4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Syngap1F6SEU4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Syngap1F6SEU4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Syngap1F6SEU4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Syngap1F6SEU4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Syngap1F6SEU4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Syngap1F6SEU4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Syngap1F6SEU4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Syngap1F6SEU4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Syngap1F6SEU4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Syngap1F6SEU4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Syngap1F6SEU4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Syngap1F6SEU4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Syngap1F6SEU4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms