Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Raph1F2Z3U3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Raph1F2Z3U3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Raph1F2Z3U3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Raph1F2Z3U3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Raph1F2Z3U3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Raph1F2Z3U3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Raph1F2Z3U3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Raph1F2Z3U3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Raph1F2Z3U3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Raph1F2Z3U3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Raph1F2Z3U3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Raph1F2Z3U3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Raph1F2Z3U3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Raph1F2Z3U3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Raph1F2Z3U3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Raph1F2Z3U3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Raph1F2Z3U3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Raph1F2Z3U3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Raph1F2Z3U3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Raph1F2Z3U3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Raph1F2Z3U3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Raph1F2Z3U3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Raph1F2Z3U3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Raph1F2Z3U3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Raph1F2Z3U3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Raph1F2Z3U3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Raph1F2Z3U3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Raph1F2Z3U3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Raph1F2Z3U3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Raph1F2Z3U3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Raph1F2Z3U3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Raph1F2Z3U3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Raph1F2Z3U3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Raph1F2Z3U3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Raph1F2Z3U3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Raph1F2Z3U3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Raph1F2Z3U3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Raph1F2Z3U3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Raph1F2Z3U3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Raph1F2Z3U3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Raph1F2Z3U3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Raph1F2Z3U3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Raph1F2Z3U3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Raph1F2Z3U3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Raph1F2Z3U3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Raph1F2Z3U3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Raph1F2Z3U3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Raph1F2Z3U3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Raph1F2Z3U3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Raph1F2Z3U3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Raph1F2Z3U3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Raph1F2Z3U3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Raph1F2Z3U3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Raph1F2Z3U3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Raph1F2Z3U3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Raph1F2Z3U3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Raph1F2Z3U3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Raph1F2Z3U3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Raph1F2Z3U3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Raph1F2Z3U3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Raph1F2Z3U3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Raph1F2Z3U3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Raph1F2Z3U3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Raph1F2Z3U3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Raph1F2Z3U3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Raph1F2Z3U3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Raph1F2Z3U3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Raph1F2Z3U3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Raph1F2Z3U3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Raph1F2Z3U3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Raph1F2Z3U3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Raph1F2Z3U3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Raph1F2Z3U3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Raph1F2Z3U3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Raph1F2Z3U3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Raph1F2Z3U3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Raph1F2Z3U3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Raph1F2Z3U3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Raph1F2Z3U3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Raph1F2Z3U3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Raph1F2Z3U3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Raph1F2Z3U3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Raph1F2Z3U3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Raph1F2Z3U3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Raph1F2Z3U3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Raph1F2Z3U3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Raph1F2Z3U3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Raph1F2Z3U3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Raph1F2Z3U3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Raph1F2Z3U3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Raph1F2Z3U3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Raph1F2Z3U3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Raph1F2Z3U3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Raph1F2Z3U3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Raph1F2Z3U3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Raph1F2Z3U3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Raph1F2Z3U3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Raph1F2Z3U3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Raph1F2Z3U3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms